Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG4Q9NPE6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG4Q9NPE6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG4Q9NPE6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPAG4Q9NPE6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPAG4Q9NPE6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPAG4Q9NPE6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPAG4Q9NPE6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPAG4Q9NPE6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPAG4Q9NPE6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPAG4Q9NPE6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPAG4Q9NPE6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPAG4Q9NPE6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPAG4Q9NPE6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPAG4Q9NPE6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPAG4Q9NPE6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPAG4Q9NPE6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPAG4Q9NPE6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPAG4Q9NPE6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPAG4Q9NPE6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPAG4Q9NPE6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPAG4Q9NPE6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPAG4Q9NPE6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPAG4Q9NPE6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPAG4Q9NPE6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPAG4Q9NPE6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG4Q9NPE6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG4Q9NPE6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPAG4Q9NPE6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG4Q9NPE6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPAG4Q9NPE6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPAG4Q9NPE6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG4Q9NPE6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG4Q9NPE6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG4Q9NPE6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG4Q9NPE6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPAG4Q9NPE6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPAG4Q9NPE6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPAG4Q9NPE6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SPAG4Q9NPE6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPAG4Q9NPE6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPAG4Q9NPE6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPAG4Q9NPE6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPAG4Q9NPE6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPAG4Q9NPE6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPAG4Q9NPE6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG4Q9NPE6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG4Q9NPE6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG4Q9NPE6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG4Q9NPE6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPAG4Q9NPE6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG4Q9NPE6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPAG4Q9NPE6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG4Q9NPE6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG4Q9NPE6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG4Q9NPE6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPAG4Q9NPE6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPAG4Q9NPE6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPAG4Q9NPE6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPAG4Q9NPE6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPAG4Q9NPE6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPAG4Q9NPE6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPAG4Q9NPE6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SPAG4Q9NPE6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPAG4Q9NPE6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPAG4Q9NPE6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPAG4Q9NPE6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPAG4Q9NPE6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPAG4Q9NPE6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPAG4Q9NPE6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPAG4Q9NPE6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPAG4Q9NPE6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPAG4Q9NPE6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPAG4Q9NPE6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPAG4Q9NPE6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPAG4Q9NPE6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPAG4Q9NPE6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPAG4Q9NPE6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPAG4Q9NPE6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPAG4Q9NPE6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPAG4Q9NPE6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPAG4Q9NPE6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms