Protein–RNA interactions for Protein: Q9H930

SP140L, Nuclear body protein SP140-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140LQ9H930 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP140LQ9H930 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP140LQ9H930 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP140LQ9H930 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP140LQ9H930 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP140LQ9H930 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SP140LQ9H930 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP140LQ9H930 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP140LQ9H930 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP140LQ9H930 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP140LQ9H930 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP140LQ9H930 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP140LQ9H930 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP140LQ9H930 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP140LQ9H930 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SP140LQ9H930 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP140LQ9H930 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SP140LQ9H930 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP140LQ9H930 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP140LQ9H930 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP140LQ9H930 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP140LQ9H930 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP140LQ9H930 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP140LQ9H930 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP140LQ9H930 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP140LQ9H930 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP140LQ9H930 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP140LQ9H930 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP140LQ9H930 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP140LQ9H930 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SP140LQ9H930 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP140LQ9H930 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP140LQ9H930 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SP140LQ9H930 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SP140LQ9H930 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SP140LQ9H930 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP140LQ9H930 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SP140LQ9H930 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP140LQ9H930 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP140LQ9H930 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms