Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPF2Q9H7B2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPF2Q9H7B2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPF2Q9H7B2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPF2Q9H7B2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPF2Q9H7B2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPF2Q9H7B2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPF2Q9H7B2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPF2Q9H7B2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPF2Q9H7B2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPF2Q9H7B2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPF2Q9H7B2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPF2Q9H7B2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPF2Q9H7B2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPF2Q9H7B2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPF2Q9H7B2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPF2Q9H7B2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RPF2Q9H7B2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPF2Q9H7B2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPF2Q9H7B2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPF2Q9H7B2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPF2Q9H7B2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPF2Q9H7B2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPF2Q9H7B2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPF2Q9H7B2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RPF2Q9H7B2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPF2Q9H7B2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPF2Q9H7B2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPF2Q9H7B2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPF2Q9H7B2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPF2Q9H7B2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPF2Q9H7B2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPF2Q9H7B2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPF2Q9H7B2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPF2Q9H7B2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPF2Q9H7B2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPF2Q9H7B2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPF2Q9H7B2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPF2Q9H7B2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPF2Q9H7B2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPF2Q9H7B2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPF2Q9H7B2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPF2Q9H7B2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPF2Q9H7B2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPF2Q9H7B2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPF2Q9H7B2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPF2Q9H7B2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RPF2Q9H7B2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPF2Q9H7B2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPF2Q9H7B2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPF2Q9H7B2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPF2Q9H7B2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPF2Q9H7B2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPF2Q9H7B2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPF2Q9H7B2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPF2Q9H7B2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RPF2Q9H7B2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPF2Q9H7B2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPF2Q9H7B2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPF2Q9H7B2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPF2Q9H7B2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPF2Q9H7B2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPF2Q9H7B2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPF2Q9H7B2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPF2Q9H7B2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPF2Q9H7B2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPF2Q9H7B2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPF2Q9H7B2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RPF2Q9H7B2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPF2Q9H7B2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPF2Q9H7B2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPF2Q9H7B2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPF2Q9H7B2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPF2Q9H7B2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPF2Q9H7B2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RPF2Q9H7B2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPF2Q9H7B2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPF2Q9H7B2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPF2Q9H7B2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPF2Q9H7B2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPF2Q9H7B2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPF2Q9H7B2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPF2Q9H7B2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPF2Q9H7B2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPF2Q9H7B2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RPF2Q9H7B2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPF2Q9H7B2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPF2Q9H7B2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPF2Q9H7B2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPF2Q9H7B2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPF2Q9H7B2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPF2Q9H7B2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPF2Q9H7B2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPF2Q9H7B2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPF2Q9H7B2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPF2Q9H7B2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPF2Q9H7B2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPF2Q9H7B2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPF2Q9H7B2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RPF2Q9H7B2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms