Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5U6

ZCCHC4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC4Q9H5U6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZCCHC4Q9H5U6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZCCHC4Q9H5U6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZCCHC4Q9H5U6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZCCHC4Q9H5U6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZCCHC4Q9H5U6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZCCHC4Q9H5U6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZCCHC4Q9H5U6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZCCHC4Q9H5U6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZCCHC4Q9H5U6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC4Q9H5U6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC4Q9H5U6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC4Q9H5U6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC4Q9H5U6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC4Q9H5U6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC4Q9H5U6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC4Q9H5U6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC4Q9H5U6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC4Q9H5U6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC4Q9H5U6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC4Q9H5U6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC4Q9H5U6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC4Q9H5U6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC4Q9H5U6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC4Q9H5U6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC4Q9H5U6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC4Q9H5U6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC4Q9H5U6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC4Q9H5U6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZCCHC4Q9H5U6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC4Q9H5U6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC4Q9H5U6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZCCHC4Q9H5U6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZCCHC4Q9H5U6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC4Q9H5U6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZCCHC4Q9H5U6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZCCHC4Q9H5U6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC4Q9H5U6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC4Q9H5U6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZCCHC4Q9H5U6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZCCHC4Q9H5U6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC4Q9H5U6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC4Q9H5U6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC4Q9H5U6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC4Q9H5U6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC4Q9H5U6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZCCHC4Q9H5U6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZCCHC4Q9H5U6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC4Q9H5U6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZCCHC4Q9H5U6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC4Q9H5U6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC4Q9H5U6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZCCHC4Q9H5U6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC4Q9H5U6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC4Q9H5U6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC4Q9H5U6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC4Q9H5U6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC4Q9H5U6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC4Q9H5U6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC4Q9H5U6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC4Q9H5U6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC4Q9H5U6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC4Q9H5U6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC4Q9H5U6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC4Q9H5U6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC4Q9H5U6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC4Q9H5U6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC4Q9H5U6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC4Q9H5U6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC4Q9H5U6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZCCHC4Q9H5U6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZCCHC4Q9H5U6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC4Q9H5U6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC4Q9H5U6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC4Q9H5U6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC4Q9H5U6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC4Q9H5U6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC4Q9H5U6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC4Q9H5U6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC4Q9H5U6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC4Q9H5U6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC4Q9H5U6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC4Q9H5U6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZCCHC4Q9H5U6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZCCHC4Q9H5U6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZCCHC4Q9H5U6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC4Q9H5U6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC4Q9H5U6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC4Q9H5U6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC4Q9H5U6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms