Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M9

EHD1, EH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1Q9H4M9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EHD1Q9H4M9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EHD1Q9H4M9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EHD1Q9H4M9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EHD1Q9H4M9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EHD1Q9H4M9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EHD1Q9H4M9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EHD1Q9H4M9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EHD1Q9H4M9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EHD1Q9H4M9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EHD1Q9H4M9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EHD1Q9H4M9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EHD1Q9H4M9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EHD1Q9H4M9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EHD1Q9H4M9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EHD1Q9H4M9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EHD1Q9H4M9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EHD1Q9H4M9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EHD1Q9H4M9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EHD1Q9H4M9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EHD1Q9H4M9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EHD1Q9H4M9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EHD1Q9H4M9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD1Q9H4M9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD1Q9H4M9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EHD1Q9H4M9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EHD1Q9H4M9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EHD1Q9H4M9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EHD1Q9H4M9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EHD1Q9H4M9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EHD1Q9H4M9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD1Q9H4M9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD1Q9H4M9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD1Q9H4M9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD1Q9H4M9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD1Q9H4M9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD1Q9H4M9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD1Q9H4M9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD1Q9H4M9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD1Q9H4M9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EHD1Q9H4M9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EHD1Q9H4M9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD1Q9H4M9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EHD1Q9H4M9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EHD1Q9H4M9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EHD1Q9H4M9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD1Q9H4M9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD1Q9H4M9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD1Q9H4M9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EHD1Q9H4M9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EHD1Q9H4M9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EHD1Q9H4M9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD1Q9H4M9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD1Q9H4M9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EHD1Q9H4M9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EHD1Q9H4M9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EHD1Q9H4M9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EHD1Q9H4M9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
EHD1Q9H4M9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHD1Q9H4M9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHD1Q9H4M9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHD1Q9H4M9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHD1Q9H4M9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHD1Q9H4M9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD1Q9H4M9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD1Q9H4M9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD1Q9H4M9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD1Q9H4M9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD1Q9H4M9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EHD1Q9H4M9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EHD1Q9H4M9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EHD1Q9H4M9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EHD1Q9H4M9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EHD1Q9H4M9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHD1Q9H4M9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHD1Q9H4M9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EHD1Q9H4M9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EHD1Q9H4M9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EHD1Q9H4M9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EHD1Q9H4M9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EHD1Q9H4M9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD1Q9H4M9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD1Q9H4M9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD1Q9H4M9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHD1Q9H4M9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHD1Q9H4M9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EHD1Q9H4M9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD1Q9H4M9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD1Q9H4M9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD1Q9H4M9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD1Q9H4M9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD1Q9H4M9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD1Q9H4M9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD1Q9H4M9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD1Q9H4M9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD1Q9H4M9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD1Q9H4M9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD1Q9H4M9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD1Q9H4M9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD1Q9H4M9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms