Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SENP3Q9H4L4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SENP3Q9H4L4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SENP3Q9H4L4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
SENP3Q9H4L4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
SENP3Q9H4L4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
SENP3Q9H4L4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
SENP3Q9H4L4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
SENP3Q9H4L4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SENP3Q9H4L4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
SENP3Q9H4L4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
SENP3Q9H4L4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
SENP3Q9H4L4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
SENP3Q9H4L4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SENP3Q9H4L4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
SENP3Q9H4L4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
SENP3Q9H4L4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SENP3Q9H4L4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
SENP3Q9H4L4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
SENP3Q9H4L4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SENP3Q9H4L4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SENP3Q9H4L4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
SENP3Q9H4L4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.49■■■■□ 3.91
SENP3Q9H4L4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SENP3Q9H4L4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SENP3Q9H4L4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
SENP3Q9H4L4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
SENP3Q9H4L4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
SENP3Q9H4L4 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SENP3Q9H4L4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
SENP3Q9H4L4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
SENP3Q9H4L4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
SENP3Q9H4L4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
SENP3Q9H4L4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
SENP3Q9H4L4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
SENP3Q9H4L4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
SENP3Q9H4L4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SENP3Q9H4L4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
SENP3Q9H4L4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
SENP3Q9H4L4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
SENP3Q9H4L4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
SENP3Q9H4L4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
SENP3Q9H4L4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SENP3Q9H4L4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SENP3Q9H4L4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
SENP3Q9H4L4 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
SENP3Q9H4L4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SENP3Q9H4L4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
SENP3Q9H4L4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
SENP3Q9H4L4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
SENP3Q9H4L4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
SENP3Q9H4L4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
SENP3Q9H4L4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SENP3Q9H4L4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SENP3Q9H4L4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
SENP3Q9H4L4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SENP3Q9H4L4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.22■■■■□ 3.87
SENP3Q9H4L4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SENP3Q9H4L4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SENP3Q9H4L4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SENP3Q9H4L4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
SENP3Q9H4L4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
SENP3Q9H4L4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
SENP3Q9H4L4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
SENP3Q9H4L4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
SENP3Q9H4L4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SENP3Q9H4L4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SENP3Q9H4L4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SENP3Q9H4L4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SENP3Q9H4L4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SENP3Q9H4L4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
SENP3Q9H4L4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SENP3Q9H4L4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SENP3Q9H4L4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SENP3Q9H4L4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SENP3Q9H4L4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
SENP3Q9H4L4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
SENP3Q9H4L4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SENP3Q9H4L4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
SENP3Q9H4L4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SENP3Q9H4L4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SENP3Q9H4L4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SENP3Q9H4L4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.02■■■■□ 3.84
SENP3Q9H4L4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SENP3Q9H4L4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
SENP3Q9H4L4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
SENP3Q9H4L4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SENP3Q9H4L4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SENP3Q9H4L4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SENP3Q9H4L4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
SENP3Q9H4L4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
SENP3Q9H4L4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SENP3Q9H4L4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SENP3Q9H4L4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SENP3Q9H4L4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SENP3Q9H4L4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
SENP3Q9H4L4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SENP3Q9H4L4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
SENP3Q9H4L4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SENP3Q9H4L4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms