Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRABDQ9H4I3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRABDQ9H4I3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRABDQ9H4I3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRABDQ9H4I3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRABDQ9H4I3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRABDQ9H4I3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRABDQ9H4I3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRABDQ9H4I3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRABDQ9H4I3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRABDQ9H4I3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRABDQ9H4I3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRABDQ9H4I3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRABDQ9H4I3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRABDQ9H4I3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRABDQ9H4I3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRABDQ9H4I3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRABDQ9H4I3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRABDQ9H4I3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRABDQ9H4I3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRABDQ9H4I3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRABDQ9H4I3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRABDQ9H4I3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRABDQ9H4I3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRABDQ9H4I3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRABDQ9H4I3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRABDQ9H4I3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRABDQ9H4I3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRABDQ9H4I3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRABDQ9H4I3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRABDQ9H4I3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRABDQ9H4I3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRABDQ9H4I3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRABDQ9H4I3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRABDQ9H4I3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRABDQ9H4I3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRABDQ9H4I3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRABDQ9H4I3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRABDQ9H4I3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRABDQ9H4I3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRABDQ9H4I3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRABDQ9H4I3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRABDQ9H4I3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRABDQ9H4I3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRABDQ9H4I3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRABDQ9H4I3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRABDQ9H4I3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRABDQ9H4I3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRABDQ9H4I3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRABDQ9H4I3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRABDQ9H4I3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRABDQ9H4I3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
TRABDQ9H4I3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRABDQ9H4I3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRABDQ9H4I3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRABDQ9H4I3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRABDQ9H4I3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRABDQ9H4I3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRABDQ9H4I3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRABDQ9H4I3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRABDQ9H4I3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRABDQ9H4I3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRABDQ9H4I3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRABDQ9H4I3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRABDQ9H4I3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRABDQ9H4I3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRABDQ9H4I3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRABDQ9H4I3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRABDQ9H4I3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRABDQ9H4I3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRABDQ9H4I3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRABDQ9H4I3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRABDQ9H4I3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRABDQ9H4I3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRABDQ9H4I3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRABDQ9H4I3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRABDQ9H4I3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRABDQ9H4I3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRABDQ9H4I3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRABDQ9H4I3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRABDQ9H4I3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRABDQ9H4I3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRABDQ9H4I3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRABDQ9H4I3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRABDQ9H4I3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRABDQ9H4I3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRABDQ9H4I3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRABDQ9H4I3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRABDQ9H4I3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRABDQ9H4I3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRABDQ9H4I3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRABDQ9H4I3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRABDQ9H4I3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRABDQ9H4I3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRABDQ9H4I3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRABDQ9H4I3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRABDQ9H4I3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRABDQ9H4I3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRABDQ9H4I3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRABDQ9H4I3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms