Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I0

RAD21L1, Double-strand-break repair protein rad21-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21L1Q9H4I0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD21L1Q9H4I0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD21L1Q9H4I0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAD21L1Q9H4I0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD21L1Q9H4I0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD21L1Q9H4I0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAD21L1Q9H4I0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAD21L1Q9H4I0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD21L1Q9H4I0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD21L1Q9H4I0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAD21L1Q9H4I0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD21L1Q9H4I0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAD21L1Q9H4I0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD21L1Q9H4I0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD21L1Q9H4I0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD21L1Q9H4I0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD21L1Q9H4I0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD21L1Q9H4I0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD21L1Q9H4I0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD21L1Q9H4I0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD21L1Q9H4I0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD21L1Q9H4I0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD21L1Q9H4I0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD21L1Q9H4I0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD21L1Q9H4I0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD21L1Q9H4I0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD21L1Q9H4I0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD21L1Q9H4I0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD21L1Q9H4I0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD21L1Q9H4I0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD21L1Q9H4I0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD21L1Q9H4I0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD21L1Q9H4I0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD21L1Q9H4I0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD21L1Q9H4I0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD21L1Q9H4I0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD21L1Q9H4I0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD21L1Q9H4I0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD21L1Q9H4I0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD21L1Q9H4I0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD21L1Q9H4I0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD21L1Q9H4I0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD21L1Q9H4I0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD21L1Q9H4I0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD21L1Q9H4I0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD21L1Q9H4I0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD21L1Q9H4I0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD21L1Q9H4I0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD21L1Q9H4I0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD21L1Q9H4I0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD21L1Q9H4I0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD21L1Q9H4I0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD21L1Q9H4I0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD21L1Q9H4I0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD21L1Q9H4I0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD21L1Q9H4I0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD21L1Q9H4I0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD21L1Q9H4I0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD21L1Q9H4I0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21L1Q9H4I0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21L1Q9H4I0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21L1Q9H4I0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD21L1Q9H4I0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD21L1Q9H4I0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD21L1Q9H4I0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD21L1Q9H4I0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD21L1Q9H4I0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD21L1Q9H4I0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD21L1Q9H4I0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD21L1Q9H4I0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD21L1Q9H4I0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD21L1Q9H4I0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD21L1Q9H4I0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD21L1Q9H4I0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD21L1Q9H4I0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD21L1Q9H4I0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD21L1Q9H4I0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD21L1Q9H4I0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD21L1Q9H4I0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms