Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J1

ARRDC1-AS1, Uncharacterized protein ARRDC1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1Q9H2J1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1Q9H2J1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1Q9H2J1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARRDC1-AS1Q9H2J1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARRDC1-AS1Q9H2J1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARRDC1-AS1Q9H2J1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms