Protein–RNA interactions for Protein: Q9H257

CARD9, Caspase recruitment domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD9Q9H257 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARD9Q9H257 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARD9Q9H257 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARD9Q9H257 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARD9Q9H257 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARD9Q9H257 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARD9Q9H257 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARD9Q9H257 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARD9Q9H257 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARD9Q9H257 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CARD9Q9H257 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARD9Q9H257 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARD9Q9H257 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CARD9Q9H257 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARD9Q9H257 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARD9Q9H257 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARD9Q9H257 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARD9Q9H257 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARD9Q9H257 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARD9Q9H257 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARD9Q9H257 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARD9Q9H257 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARD9Q9H257 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARD9Q9H257 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARD9Q9H257 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARD9Q9H257 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARD9Q9H257 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARD9Q9H257 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARD9Q9H257 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARD9Q9H257 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARD9Q9H257 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARD9Q9H257 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARD9Q9H257 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD9Q9H257 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD9Q9H257 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD9Q9H257 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD9Q9H257 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARD9Q9H257 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARD9Q9H257 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARD9Q9H257 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARD9Q9H257 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARD9Q9H257 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARD9Q9H257 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARD9Q9H257 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARD9Q9H257 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CARD9Q9H257 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CARD9Q9H257 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARD9Q9H257 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARD9Q9H257 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CARD9Q9H257 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARD9Q9H257 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD9Q9H257 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD9Q9H257 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD9Q9H257 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD9Q9H257 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD9Q9H257 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD9Q9H257 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD9Q9H257 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD9Q9H257 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD9Q9H257 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARD9Q9H257 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARD9Q9H257 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD9Q9H257 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD9Q9H257 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD9Q9H257 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD9Q9H257 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD9Q9H257 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD9Q9H257 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARD9Q9H257 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD9Q9H257 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD9Q9H257 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD9Q9H257 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD9Q9H257 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARD9Q9H257 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD9Q9H257 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD9Q9H257 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD9Q9H257 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD9Q9H257 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD9Q9H257 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARD9Q9H257 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARD9Q9H257 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms