Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD1Q9GZZ0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD1Q9GZZ0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD1Q9GZZ0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD1Q9GZZ0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD1Q9GZZ0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD1Q9GZZ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD1Q9GZZ0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD1Q9GZZ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD1Q9GZZ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXD1Q9GZZ0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD1Q9GZZ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD1Q9GZZ0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD1Q9GZZ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD1Q9GZZ0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD1Q9GZZ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD1Q9GZZ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD1Q9GZZ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD1Q9GZZ0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD1Q9GZZ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXD1Q9GZZ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXD1Q9GZZ0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD1Q9GZZ0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD1Q9GZZ0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD1Q9GZZ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXD1Q9GZZ0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD1Q9GZZ0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD1Q9GZZ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXD1Q9GZZ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD1Q9GZZ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXD1Q9GZZ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXD1Q9GZZ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD1Q9GZZ0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXD1Q9GZZ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HOXD1Q9GZZ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD1Q9GZZ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD1Q9GZZ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXD1Q9GZZ0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD1Q9GZZ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXD1Q9GZZ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXD1Q9GZZ0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXD1Q9GZZ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD1Q9GZZ0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXD1Q9GZZ0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD1Q9GZZ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXD1Q9GZZ0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD1Q9GZZ0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD1Q9GZZ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD1Q9GZZ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD1Q9GZZ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD1Q9GZZ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD1Q9GZZ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD1Q9GZZ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXD1Q9GZZ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXD1Q9GZZ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD1Q9GZZ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD1Q9GZZ0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD1Q9GZZ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD1Q9GZZ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD1Q9GZZ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD1Q9GZZ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD1Q9GZZ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD1Q9GZZ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD1Q9GZZ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD1Q9GZZ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD1Q9GZZ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD1Q9GZZ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD1Q9GZZ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD1Q9GZZ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD1Q9GZZ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD1Q9GZZ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD1Q9GZZ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD1Q9GZZ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD1Q9GZZ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD1Q9GZZ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD1Q9GZZ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD1Q9GZZ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD1Q9GZZ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD1Q9GZZ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD1Q9GZZ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD1Q9GZZ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD1Q9GZZ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD1Q9GZZ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD1Q9GZZ0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD1Q9GZZ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD1Q9GZZ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD1Q9GZZ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD1Q9GZZ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD1Q9GZZ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXD1Q9GZZ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD1Q9GZZ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD1Q9GZZ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD1Q9GZZ0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXD1Q9GZZ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXD1Q9GZZ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXD1Q9GZZ0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms