Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YIPF3Q9GZM5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
YIPF3Q9GZM5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YIPF3Q9GZM5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YIPF3Q9GZM5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YIPF3Q9GZM5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YIPF3Q9GZM5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF3Q9GZM5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF3Q9GZM5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF3Q9GZM5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF3Q9GZM5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YIPF3Q9GZM5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YIPF3Q9GZM5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
YIPF3Q9GZM5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YIPF3Q9GZM5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YIPF3Q9GZM5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YIPF3Q9GZM5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YIPF3Q9GZM5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YIPF3Q9GZM5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
YIPF3Q9GZM5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YIPF3Q9GZM5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YIPF3Q9GZM5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
YIPF3Q9GZM5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YIPF3Q9GZM5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
YIPF3Q9GZM5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
YIPF3Q9GZM5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YIPF3Q9GZM5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YIPF3Q9GZM5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YIPF3Q9GZM5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YIPF3Q9GZM5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YIPF3Q9GZM5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YIPF3Q9GZM5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
YIPF3Q9GZM5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
YIPF3Q9GZM5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
YIPF3Q9GZM5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YIPF3Q9GZM5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YIPF3Q9GZM5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YIPF3Q9GZM5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
YIPF3Q9GZM5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
YIPF3Q9GZM5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
YIPF3Q9GZM5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
YIPF3Q9GZM5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
YIPF3Q9GZM5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YIPF3Q9GZM5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YIPF3Q9GZM5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YIPF3Q9GZM5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YIPF3Q9GZM5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YIPF3Q9GZM5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YIPF3Q9GZM5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YIPF3Q9GZM5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YIPF3Q9GZM5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
YIPF3Q9GZM5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YIPF3Q9GZM5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YIPF3Q9GZM5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YIPF3Q9GZM5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YIPF3Q9GZM5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YIPF3Q9GZM5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YIPF3Q9GZM5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
YIPF3Q9GZM5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
YIPF3Q9GZM5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
YIPF3Q9GZM5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
YIPF3Q9GZM5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
YIPF3Q9GZM5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
YIPF3Q9GZM5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
YIPF3Q9GZM5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
YIPF3Q9GZM5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
YIPF3Q9GZM5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
YIPF3Q9GZM5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
YIPF3Q9GZM5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
YIPF3Q9GZM5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
YIPF3Q9GZM5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YIPF3Q9GZM5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YIPF3Q9GZM5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YIPF3Q9GZM5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
YIPF3Q9GZM5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YIPF3Q9GZM5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YIPF3Q9GZM5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YIPF3Q9GZM5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YIPF3Q9GZM5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
YIPF3Q9GZM5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
YIPF3Q9GZM5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
YIPF3Q9GZM5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
YIPF3Q9GZM5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
YIPF3Q9GZM5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
YIPF3Q9GZM5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
YIPF3Q9GZM5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
YIPF3Q9GZM5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
YIPF3Q9GZM5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YIPF3Q9GZM5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YIPF3Q9GZM5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YIPF3Q9GZM5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YIPF3Q9GZM5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YIPF3Q9GZM5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YIPF3Q9GZM5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YIPF3Q9GZM5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms