Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J1

B3GNT4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT4Q9C0J1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
B3GNT4Q9C0J1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
B3GNT4Q9C0J1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
B3GNT4Q9C0J1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
B3GNT4Q9C0J1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
B3GNT4Q9C0J1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
B3GNT4Q9C0J1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
B3GNT4Q9C0J1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
B3GNT4Q9C0J1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
B3GNT4Q9C0J1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
B3GNT4Q9C0J1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
B3GNT4Q9C0J1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
B3GNT4Q9C0J1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
B3GNT4Q9C0J1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
B3GNT4Q9C0J1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
B3GNT4Q9C0J1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
B3GNT4Q9C0J1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
B3GNT4Q9C0J1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
B3GNT4Q9C0J1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
B3GNT4Q9C0J1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
B3GNT4Q9C0J1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
B3GNT4Q9C0J1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
B3GNT4Q9C0J1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
B3GNT4Q9C0J1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
B3GNT4Q9C0J1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
B3GNT4Q9C0J1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B3GNT4Q9C0J1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
B3GNT4Q9C0J1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
B3GNT4Q9C0J1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
B3GNT4Q9C0J1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
B3GNT4Q9C0J1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
B3GNT4Q9C0J1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
B3GNT4Q9C0J1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
B3GNT4Q9C0J1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
B3GNT4Q9C0J1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
B3GNT4Q9C0J1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
B3GNT4Q9C0J1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
B3GNT4Q9C0J1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
B3GNT4Q9C0J1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B3GNT4Q9C0J1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B3GNT4Q9C0J1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B3GNT4Q9C0J1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
B3GNT4Q9C0J1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B3GNT4Q9C0J1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
B3GNT4Q9C0J1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
B3GNT4Q9C0J1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
B3GNT4Q9C0J1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
B3GNT4Q9C0J1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
B3GNT4Q9C0J1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
B3GNT4Q9C0J1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
B3GNT4Q9C0J1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
B3GNT4Q9C0J1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
B3GNT4Q9C0J1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
B3GNT4Q9C0J1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
B3GNT4Q9C0J1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
B3GNT4Q9C0J1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
B3GNT4Q9C0J1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
B3GNT4Q9C0J1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
B3GNT4Q9C0J1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
B3GNT4Q9C0J1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
B3GNT4Q9C0J1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
B3GNT4Q9C0J1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
B3GNT4Q9C0J1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
B3GNT4Q9C0J1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
B3GNT4Q9C0J1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
B3GNT4Q9C0J1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
B3GNT4Q9C0J1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
B3GNT4Q9C0J1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
B3GNT4Q9C0J1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
B3GNT4Q9C0J1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
B3GNT4Q9C0J1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
B3GNT4Q9C0J1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
B3GNT4Q9C0J1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
B3GNT4Q9C0J1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
B3GNT4Q9C0J1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
B3GNT4Q9C0J1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
B3GNT4Q9C0J1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
B3GNT4Q9C0J1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
B3GNT4Q9C0J1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
B3GNT4Q9C0J1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
B3GNT4Q9C0J1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms