Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM8Q9BZR9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM8Q9BZR9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM8Q9BZR9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM8Q9BZR9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM8Q9BZR9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM8Q9BZR9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM8Q9BZR9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM8Q9BZR9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM8Q9BZR9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM8Q9BZR9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM8Q9BZR9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM8Q9BZR9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM8Q9BZR9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM8Q9BZR9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM8Q9BZR9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM8Q9BZR9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM8Q9BZR9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM8Q9BZR9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM8Q9BZR9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM8Q9BZR9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM8Q9BZR9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM8Q9BZR9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM8Q9BZR9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM8Q9BZR9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM8Q9BZR9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM8Q9BZR9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM8Q9BZR9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM8Q9BZR9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM8Q9BZR9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM8Q9BZR9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM8Q9BZR9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM8Q9BZR9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM8Q9BZR9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM8Q9BZR9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM8Q9BZR9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM8Q9BZR9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM8Q9BZR9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM8Q9BZR9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM8Q9BZR9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM8Q9BZR9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM8Q9BZR9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM8Q9BZR9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM8Q9BZR9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM8Q9BZR9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM8Q9BZR9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM8Q9BZR9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM8Q9BZR9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM8Q9BZR9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM8Q9BZR9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM8Q9BZR9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM8Q9BZR9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM8Q9BZR9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM8Q9BZR9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM8Q9BZR9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM8Q9BZR9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM8Q9BZR9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM8Q9BZR9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM8Q9BZR9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM8Q9BZR9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM8Q9BZR9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM8Q9BZR9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM8Q9BZR9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM8Q9BZR9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM8Q9BZR9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM8Q9BZR9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM8Q9BZR9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM8Q9BZR9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM8Q9BZR9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM8Q9BZR9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM8Q9BZR9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM8Q9BZR9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM8Q9BZR9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM8Q9BZR9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM8Q9BZR9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM8Q9BZR9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM8Q9BZR9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM8Q9BZR9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM8Q9BZR9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM8Q9BZR9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM8Q9BZR9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM8Q9BZR9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM8Q9BZR9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM8Q9BZR9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM8Q9BZR9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM8Q9BZR9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM8Q9BZR9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM8Q9BZR9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM8Q9BZR9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM8Q9BZR9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM8Q9BZR9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM8Q9BZR9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM8Q9BZR9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM8Q9BZR9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM8Q9BZR9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM8Q9BZR9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM8Q9BZR9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM8Q9BZR9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM8Q9BZR9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM8Q9BZR9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms