Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM55Q9BYV6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM55Q9BYV6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM55Q9BYV6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM55Q9BYV6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM55Q9BYV6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM55Q9BYV6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM55Q9BYV6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM55Q9BYV6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM55Q9BYV6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM55Q9BYV6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM55Q9BYV6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM55Q9BYV6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM55Q9BYV6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM55Q9BYV6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM55Q9BYV6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM55Q9BYV6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM55Q9BYV6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM55Q9BYV6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM55Q9BYV6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM55Q9BYV6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM55Q9BYV6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM55Q9BYV6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM55Q9BYV6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM55Q9BYV6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM55Q9BYV6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM55Q9BYV6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM55Q9BYV6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM55Q9BYV6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM55Q9BYV6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM55Q9BYV6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM55Q9BYV6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM55Q9BYV6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM55Q9BYV6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM55Q9BYV6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM55Q9BYV6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM55Q9BYV6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM55Q9BYV6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM55Q9BYV6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM55Q9BYV6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM55Q9BYV6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM55Q9BYV6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM55Q9BYV6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM55Q9BYV6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM55Q9BYV6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM55Q9BYV6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM55Q9BYV6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM55Q9BYV6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM55Q9BYV6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM55Q9BYV6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM55Q9BYV6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM55Q9BYV6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM55Q9BYV6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM55Q9BYV6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM55Q9BYV6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM55Q9BYV6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM55Q9BYV6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM55Q9BYV6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM55Q9BYV6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM55Q9BYV6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM55Q9BYV6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM55Q9BYV6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM55Q9BYV6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM55Q9BYV6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM55Q9BYV6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM55Q9BYV6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM55Q9BYV6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM55Q9BYV6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM55Q9BYV6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM55Q9BYV6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM55Q9BYV6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM55Q9BYV6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM55Q9BYV6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM55Q9BYV6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM55Q9BYV6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM55Q9BYV6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM55Q9BYV6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM55Q9BYV6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRIM55Q9BYV6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM55Q9BYV6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM55Q9BYV6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM55Q9BYV6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM55Q9BYV6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM55Q9BYV6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM55Q9BYV6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM55Q9BYV6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM55Q9BYV6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM55Q9BYV6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM55Q9BYV6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM55Q9BYV6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM55Q9BYV6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM55Q9BYV6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM55Q9BYV6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM55Q9BYV6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM55Q9BYV6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM55Q9BYV6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM55Q9BYV6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms