Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHANK2-AS3Q9BTD1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHANK2-AS3Q9BTD1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHANK2-AS3Q9BTD1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHANK2-AS3Q9BTD1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SHANK2-AS3Q9BTD1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SHANK2-AS3Q9BTD1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SHANK2-AS3Q9BTD1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHANK2-AS3Q9BTD1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SHANK2-AS3Q9BTD1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SHANK2-AS3Q9BTD1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SHANK2-AS3Q9BTD1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHANK2-AS3Q9BTD1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHANK2-AS3Q9BTD1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SHANK2-AS3Q9BTD1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SHANK2-AS3Q9BTD1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHANK2-AS3Q9BTD1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHANK2-AS3Q9BTD1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHANK2-AS3Q9BTD1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHANK2-AS3Q9BTD1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHANK2-AS3Q9BTD1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHANK2-AS3Q9BTD1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHANK2-AS3Q9BTD1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHANK2-AS3Q9BTD1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHANK2-AS3Q9BTD1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHANK2-AS3Q9BTD1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms