Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP3BQ9BS92 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP3BQ9BS92 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP3BQ9BS92 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP3BQ9BS92 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP3BQ9BS92 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP3BQ9BS92 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP3BQ9BS92 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP3BQ9BS92 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIPSNAP3BQ9BS92 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP3BQ9BS92 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP3BQ9BS92 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP3BQ9BS92 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIPSNAP3BQ9BS92 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP3BQ9BS92 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIPSNAP3BQ9BS92 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP3BQ9BS92 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIPSNAP3BQ9BS92 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP3BQ9BS92 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP3BQ9BS92 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP3BQ9BS92 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP3BQ9BS92 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP3BQ9BS92 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP3BQ9BS92 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP3BQ9BS92 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP3BQ9BS92 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP3BQ9BS92 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP3BQ9BS92 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP3BQ9BS92 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP3BQ9BS92 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP3BQ9BS92 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP3BQ9BS92 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP3BQ9BS92 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP3BQ9BS92 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP3BQ9BS92 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP3BQ9BS92 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP3BQ9BS92 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP3BQ9BS92 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP3BQ9BS92 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP3BQ9BS92 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP3BQ9BS92 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP3BQ9BS92 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP3BQ9BS92 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP3BQ9BS92 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP3BQ9BS92 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP3BQ9BS92 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP3BQ9BS92 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms