Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG2

NUDT12, Peroxisomal NADH pyrophosphatase NUDT12, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT12Q9BQG2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NUDT12Q9BQG2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUDT12Q9BQG2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUDT12Q9BQG2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUDT12Q9BQG2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUDT12Q9BQG2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUDT12Q9BQG2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUDT12Q9BQG2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUDT12Q9BQG2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUDT12Q9BQG2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUDT12Q9BQG2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUDT12Q9BQG2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUDT12Q9BQG2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUDT12Q9BQG2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUDT12Q9BQG2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUDT12Q9BQG2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
NUDT12Q9BQG2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NUDT12Q9BQG2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NUDT12Q9BQG2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUDT12Q9BQG2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUDT12Q9BQG2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUDT12Q9BQG2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUDT12Q9BQG2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUDT12Q9BQG2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUDT12Q9BQG2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUDT12Q9BQG2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUDT12Q9BQG2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUDT12Q9BQG2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUDT12Q9BQG2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUDT12Q9BQG2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUDT12Q9BQG2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NUDT12Q9BQG2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUDT12Q9BQG2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUDT12Q9BQG2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUDT12Q9BQG2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
NUDT12Q9BQG2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUDT12Q9BQG2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NUDT12Q9BQG2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NUDT12Q9BQG2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NUDT12Q9BQG2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NUDT12Q9BQG2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NUDT12Q9BQG2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NUDT12Q9BQG2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
NUDT12Q9BQG2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NUDT12Q9BQG2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NUDT12Q9BQG2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NUDT12Q9BQG2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NUDT12Q9BQG2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NUDT12Q9BQG2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NUDT12Q9BQG2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NUDT12Q9BQG2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NUDT12Q9BQG2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NUDT12Q9BQG2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NUDT12Q9BQG2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NUDT12Q9BQG2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NUDT12Q9BQG2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NUDT12Q9BQG2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NUDT12Q9BQG2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NUDT12Q9BQG2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NUDT12Q9BQG2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NUDT12Q9BQG2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NUDT12Q9BQG2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NUDT12Q9BQG2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NUDT12Q9BQG2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NUDT12Q9BQG2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NUDT12Q9BQG2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NUDT12Q9BQG2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NUDT12Q9BQG2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NUDT12Q9BQG2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NUDT12Q9BQG2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NUDT12Q9BQG2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NUDT12Q9BQG2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NUDT12Q9BQG2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NUDT12Q9BQG2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NUDT12Q9BQG2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NUDT12Q9BQG2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NUDT12Q9BQG2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
NUDT12Q9BQG2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NUDT12Q9BQG2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUDT12Q9BQG2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUDT12Q9BQG2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUDT12Q9BQG2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUDT12Q9BQG2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUDT12Q9BQG2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NUDT12Q9BQG2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NUDT12Q9BQG2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NUDT12Q9BQG2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NUDT12Q9BQG2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUDT12Q9BQG2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUDT12Q9BQG2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUDT12Q9BQG2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUDT12Q9BQG2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUDT12Q9BQG2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUDT12Q9BQG2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUDT12Q9BQG2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NUDT12Q9BQG2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NUDT12Q9BQG2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NUDT12Q9BQG2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUDT12Q9BQG2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUDT12Q9BQG2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms