Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PITX2Q99697 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PITX2Q99697 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PITX2Q99697 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PITX2Q99697 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PITX2Q99697 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PITX2Q99697 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PITX2Q99697 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PITX2Q99697 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PITX2Q99697 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PITX2Q99697 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PITX2Q99697 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PITX2Q99697 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PITX2Q99697 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PITX2Q99697 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITX2Q99697 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITX2Q99697 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITX2Q99697 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITX2Q99697 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PITX2Q99697 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITX2Q99697 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITX2Q99697 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITX2Q99697 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITX2Q99697 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITX2Q99697 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITX2Q99697 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITX2Q99697 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITX2Q99697 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITX2Q99697 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITX2Q99697 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITX2Q99697 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITX2Q99697 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITX2Q99697 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITX2Q99697 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITX2Q99697 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITX2Q99697 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITX2Q99697 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PITX2Q99697 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITX2Q99697 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PITX2Q99697 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITX2Q99697 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITX2Q99697 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PITX2Q99697 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PITX2Q99697 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PITX2Q99697 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITX2Q99697 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITX2Q99697 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PITX2Q99697 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PITX2Q99697 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PITX2Q99697 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PITX2Q99697 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PITX2Q99697 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PITX2Q99697 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PITX2Q99697 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITX2Q99697 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITX2Q99697 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITX2Q99697 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITX2Q99697 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITX2Q99697 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITX2Q99697 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITX2Q99697 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITX2Q99697 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITX2Q99697 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITX2Q99697 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITX2Q99697 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITX2Q99697 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITX2Q99697 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITX2Q99697 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITX2Q99697 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITX2Q99697 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITX2Q99697 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITX2Q99697 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITX2Q99697 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITX2Q99697 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITX2Q99697 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITX2Q99697 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITX2Q99697 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITX2Q99697 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITX2Q99697 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITX2Q99697 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITX2Q99697 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITX2Q99697 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITX2Q99697 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITX2Q99697 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITX2Q99697 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITX2Q99697 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITX2Q99697 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.5 ms