Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
RGPD5Q99666 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RGPD5Q99666 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
RGPD5Q99666 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
RGPD5Q99666 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RGPD5Q99666 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RGPD5Q99666 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RGPD5Q99666 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RGPD5Q99666 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RGPD5Q99666 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RGPD5Q99666 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RGPD5Q99666 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RGPD5Q99666 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RGPD5Q99666 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RGPD5Q99666 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RGPD5Q99666 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
RGPD5Q99666 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
RGPD5Q99666 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RGPD5Q99666 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RGPD5Q99666 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RGPD5Q99666 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RGPD5Q99666 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RGPD5Q99666 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RGPD5Q99666 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RGPD5Q99666 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
RGPD5Q99666 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RGPD5Q99666 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RGPD5Q99666 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RGPD5Q99666 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RGPD5Q99666 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RGPD5Q99666 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RGPD5Q99666 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RGPD5Q99666 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RGPD5Q99666 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RGPD5Q99666 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RGPD5Q99666 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RGPD5Q99666 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RGPD5Q99666 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RGPD5Q99666 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
RGPD5Q99666 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RGPD5Q99666 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RGPD5Q99666 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RGPD5Q99666 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RGPD5Q99666 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RGPD5Q99666 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RGPD5Q99666 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RGPD5Q99666 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RGPD5Q99666 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RGPD5Q99666 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RGPD5Q99666 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RGPD5Q99666 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RGPD5Q99666 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RGPD5Q99666 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RGPD5Q99666 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RGPD5Q99666 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RGPD5Q99666 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RGPD5Q99666 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RGPD5Q99666 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RGPD5Q99666 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RGPD5Q99666 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RGPD5Q99666 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RGPD5Q99666 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RGPD5Q99666 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RGPD5Q99666 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RGPD5Q99666 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RGPD5Q99666 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RGPD5Q99666 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RGPD5Q99666 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RGPD5Q99666 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RGPD5Q99666 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RGPD5Q99666 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RGPD5Q99666 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
RGPD5Q99666 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RGPD5Q99666 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RGPD5Q99666 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RGPD5Q99666 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RGPD5Q99666 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RGPD5Q99666 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RGPD5Q99666 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RGPD5Q99666 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RGPD5Q99666 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RGPD5Q99666 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RGPD5Q99666 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
RGPD5Q99666 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RGPD5Q99666 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RGPD5Q99666 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
RGPD5Q99666 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RGPD5Q99666 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RGPD5Q99666 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
RGPD5Q99666 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RGPD5Q99666 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
RGPD5Q99666 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RGPD5Q99666 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
RGPD5Q99666 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
RGPD5Q99666 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RGPD5Q99666 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RGPD5Q99666 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RGPD5Q99666 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RGPD5Q99666 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RGPD5Q99666 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms