Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
EYA3Q99504 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
EYA3Q99504 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
EYA3Q99504 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
EYA3Q99504 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
EYA3Q99504 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
EYA3Q99504 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
EYA3Q99504 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
EYA3Q99504 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
EYA3Q99504 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
EYA3Q99504 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
EYA3Q99504 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
EYA3Q99504 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
EYA3Q99504 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
EYA3Q99504 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
EYA3Q99504 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
EYA3Q99504 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
EYA3Q99504 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
EYA3Q99504 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
EYA3Q99504 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
EYA3Q99504 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
EYA3Q99504 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
EYA3Q99504 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
EYA3Q99504 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
EYA3Q99504 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
EYA3Q99504 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
EYA3Q99504 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
EYA3Q99504 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
EYA3Q99504 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
EYA3Q99504 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
EYA3Q99504 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
EYA3Q99504 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EYA3Q99504 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EYA3Q99504 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
EYA3Q99504 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
EYA3Q99504 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
EYA3Q99504 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
EYA3Q99504 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
EYA3Q99504 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
EYA3Q99504 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
EYA3Q99504 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
EYA3Q99504 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
EYA3Q99504 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
EYA3Q99504 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EYA3Q99504 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EYA3Q99504 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
EYA3Q99504 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
EYA3Q99504 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EYA3Q99504 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EYA3Q99504 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EYA3Q99504 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
EYA3Q99504 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
EYA3Q99504 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EYA3Q99504 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
EYA3Q99504 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
EYA3Q99504 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
EYA3Q99504 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EYA3Q99504 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EYA3Q99504 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
EYA3Q99504 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EYA3Q99504 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EYA3Q99504 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
EYA3Q99504 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
EYA3Q99504 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
EYA3Q99504 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
EYA3Q99504 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
EYA3Q99504 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
EYA3Q99504 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
EYA3Q99504 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
EYA3Q99504 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
EYA3Q99504 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
EYA3Q99504 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
EYA3Q99504 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
EYA3Q99504 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
EYA3Q99504 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
EYA3Q99504 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
EYA3Q99504 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
EYA3Q99504 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
EYA3Q99504 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
EYA3Q99504 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
EYA3Q99504 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
EYA3Q99504 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
EYA3Q99504 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
EYA3Q99504 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
EYA3Q99504 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
EYA3Q99504 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
EYA3Q99504 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
EYA3Q99504 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
EYA3Q99504 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
EYA3Q99504 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
EYA3Q99504 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
EYA3Q99504 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
EYA3Q99504 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
EYA3Q99504 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
EYA3Q99504 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
EYA3Q99504 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
EYA3Q99504 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
EYA3Q99504 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
EYA3Q99504 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
EYA3Q99504 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms