Protein–RNA interactions for Protein: Q99436

PSMB7, Proteasome subunit beta type-7, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB7Q99436 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMB7Q99436 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMB7Q99436 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMB7Q99436 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMB7Q99436 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSMB7Q99436 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMB7Q99436 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSMB7Q99436 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSMB7Q99436 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PSMB7Q99436 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PSMB7Q99436 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMB7Q99436 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMB7Q99436 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMB7Q99436 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSMB7Q99436 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSMB7Q99436 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMB7Q99436 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMB7Q99436 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSMB7Q99436 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSMB7Q99436 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMB7Q99436 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMB7Q99436 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMB7Q99436 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSMB7Q99436 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSMB7Q99436 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSMB7Q99436 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSMB7Q99436 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSMB7Q99436 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSMB7Q99436 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSMB7Q99436 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMB7Q99436 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMB7Q99436 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMB7Q99436 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMB7Q99436 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMB7Q99436 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMB7Q99436 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMB7Q99436 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSMB7Q99436 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PSMB7Q99436 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSMB7Q99436 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMB7Q99436 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMB7Q99436 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMB7Q99436 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSMB7Q99436 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSMB7Q99436 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSMB7Q99436 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMB7Q99436 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMB7Q99436 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMB7Q99436 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMB7Q99436 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PSMB7Q99436 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMB7Q99436 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMB7Q99436 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMB7Q99436 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMB7Q99436 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMB7Q99436 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMB7Q99436 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PSMB7Q99436 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PSMB7Q99436 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMB7Q99436 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMB7Q99436 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMB7Q99436 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMB7Q99436 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMB7Q99436 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMB7Q99436 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMB7Q99436 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMB7Q99436 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMB7Q99436 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMB7Q99436 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMB7Q99436 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMB7Q99436 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMB7Q99436 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMB7Q99436 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMB7Q99436 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMB7Q99436 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMB7Q99436 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMB7Q99436 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMB7Q99436 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSMB7Q99436 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSMB7Q99436 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMB7Q99436 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMB7Q99436 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMB7Q99436 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMB7Q99436 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMB7Q99436 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMB7Q99436 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PSMB7Q99436 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMB7Q99436 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMB7Q99436 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMB7Q99436 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMB7Q99436 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMB7Q99436 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMB7Q99436 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMB7Q99436 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMB7Q99436 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMB7Q99436 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMB7Q99436 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMB7Q99436 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMB7Q99436 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMB7Q99436 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms