Protein–RNA interactions for Protein: Q96T58

SPEN, Msx2-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPENQ96T58 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPENQ96T58 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPENQ96T58 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPENQ96T58 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPENQ96T58 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPENQ96T58 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPENQ96T58 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPENQ96T58 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPENQ96T58 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPENQ96T58 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPENQ96T58 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPENQ96T58 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPENQ96T58 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPENQ96T58 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPENQ96T58 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPENQ96T58 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPENQ96T58 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPENQ96T58 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPENQ96T58 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPENQ96T58 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPENQ96T58 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPENQ96T58 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPENQ96T58 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPENQ96T58 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPENQ96T58 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPENQ96T58 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPENQ96T58 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPENQ96T58 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPENQ96T58 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPENQ96T58 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPENQ96T58 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPENQ96T58 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPENQ96T58 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPENQ96T58 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPENQ96T58 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPENQ96T58 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPENQ96T58 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPENQ96T58 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPENQ96T58 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPENQ96T58 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SPENQ96T58 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPENQ96T58 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPENQ96T58 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPENQ96T58 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPENQ96T58 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPENQ96T58 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPENQ96T58 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPENQ96T58 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPENQ96T58 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPENQ96T58 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPENQ96T58 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPENQ96T58 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPENQ96T58 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPENQ96T58 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPENQ96T58 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPENQ96T58 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPENQ96T58 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPENQ96T58 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPENQ96T58 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPENQ96T58 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPENQ96T58 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPENQ96T58 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPENQ96T58 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPENQ96T58 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPENQ96T58 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPENQ96T58 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPENQ96T58 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPENQ96T58 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPENQ96T58 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPENQ96T58 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPENQ96T58 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPENQ96T58 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPENQ96T58 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPENQ96T58 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPENQ96T58 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPENQ96T58 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPENQ96T58 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPENQ96T58 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPENQ96T58 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPENQ96T58 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPENQ96T58 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPENQ96T58 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPENQ96T58 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPENQ96T58 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPENQ96T58 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPENQ96T58 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPENQ96T58 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPENQ96T58 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPENQ96T58 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPENQ96T58 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPENQ96T58 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPENQ96T58 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPENQ96T58 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPENQ96T58 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPENQ96T58 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPENQ96T58 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPENQ96T58 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms