Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CRAMP1Q96RY5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CRAMP1Q96RY5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CRAMP1Q96RY5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CRAMP1Q96RY5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CRAMP1Q96RY5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CRAMP1Q96RY5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CRAMP1Q96RY5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CRAMP1Q96RY5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CRAMP1Q96RY5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CRAMP1Q96RY5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CRAMP1Q96RY5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CRAMP1Q96RY5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CRAMP1Q96RY5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CRAMP1Q96RY5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CRAMP1Q96RY5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CRAMP1Q96RY5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CRAMP1Q96RY5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CRAMP1Q96RY5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CRAMP1Q96RY5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CRAMP1Q96RY5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CRAMP1Q96RY5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CRAMP1Q96RY5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CRAMP1Q96RY5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CRAMP1Q96RY5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CRAMP1Q96RY5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CRAMP1Q96RY5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CRAMP1Q96RY5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CRAMP1Q96RY5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CRAMP1Q96RY5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CRAMP1Q96RY5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CRAMP1Q96RY5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CRAMP1Q96RY5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CRAMP1Q96RY5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CRAMP1Q96RY5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CRAMP1Q96RY5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CRAMP1Q96RY5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CRAMP1Q96RY5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CRAMP1Q96RY5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CRAMP1Q96RY5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CRAMP1Q96RY5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CRAMP1Q96RY5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CRAMP1Q96RY5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CRAMP1Q96RY5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CRAMP1Q96RY5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CRAMP1Q96RY5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CRAMP1Q96RY5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CRAMP1Q96RY5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CRAMP1Q96RY5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CRAMP1Q96RY5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CRAMP1Q96RY5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CRAMP1Q96RY5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CRAMP1Q96RY5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CRAMP1Q96RY5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CRAMP1Q96RY5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CRAMP1Q96RY5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CRAMP1Q96RY5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CRAMP1Q96RY5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CRAMP1Q96RY5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CRAMP1Q96RY5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CRAMP1Q96RY5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CRAMP1Q96RY5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CRAMP1Q96RY5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CRAMP1Q96RY5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CRAMP1Q96RY5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CRAMP1Q96RY5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CRAMP1Q96RY5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CRAMP1Q96RY5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CRAMP1Q96RY5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CRAMP1Q96RY5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CRAMP1Q96RY5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CRAMP1Q96RY5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CRAMP1Q96RY5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CRAMP1Q96RY5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CRAMP1Q96RY5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CRAMP1Q96RY5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CRAMP1Q96RY5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CRAMP1Q96RY5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CRAMP1Q96RY5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CRAMP1Q96RY5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CRAMP1Q96RY5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CRAMP1Q96RY5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CRAMP1Q96RY5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CRAMP1Q96RY5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CRAMP1Q96RY5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CRAMP1Q96RY5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CRAMP1Q96RY5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CRAMP1Q96RY5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CRAMP1Q96RY5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CRAMP1Q96RY5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CRAMP1Q96RY5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CRAMP1Q96RY5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CRAMP1Q96RY5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CRAMP1Q96RY5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CRAMP1Q96RY5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CRAMP1Q96RY5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CRAMP1Q96RY5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CRAMP1Q96RY5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CRAMP1Q96RY5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CRAMP1Q96RY5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms