Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNC2Q96PR1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNC2Q96PR1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNC2Q96PR1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNC2Q96PR1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNC2Q96PR1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNC2Q96PR1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNC2Q96PR1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNC2Q96PR1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNC2Q96PR1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNC2Q96PR1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNC2Q96PR1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNC2Q96PR1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNC2Q96PR1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNC2Q96PR1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNC2Q96PR1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNC2Q96PR1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNC2Q96PR1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNC2Q96PR1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNC2Q96PR1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNC2Q96PR1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNC2Q96PR1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNC2Q96PR1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNC2Q96PR1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNC2Q96PR1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KCNC2Q96PR1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNC2Q96PR1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNC2Q96PR1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNC2Q96PR1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNC2Q96PR1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNC2Q96PR1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNC2Q96PR1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNC2Q96PR1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KCNC2Q96PR1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNC2Q96PR1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNC2Q96PR1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNC2Q96PR1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNC2Q96PR1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNC2Q96PR1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNC2Q96PR1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNC2Q96PR1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNC2Q96PR1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNC2Q96PR1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNC2Q96PR1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNC2Q96PR1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNC2Q96PR1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNC2Q96PR1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNC2Q96PR1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNC2Q96PR1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNC2Q96PR1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNC2Q96PR1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNC2Q96PR1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNC2Q96PR1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNC2Q96PR1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNC2Q96PR1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNC2Q96PR1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNC2Q96PR1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNC2Q96PR1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNC2Q96PR1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNC2Q96PR1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNC2Q96PR1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNC2Q96PR1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNC2Q96PR1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNC2Q96PR1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNC2Q96PR1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNC2Q96PR1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNC2Q96PR1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNC2Q96PR1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNC2Q96PR1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNC2Q96PR1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNC2Q96PR1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNC2Q96PR1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNC2Q96PR1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNC2Q96PR1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNC2Q96PR1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNC2Q96PR1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNC2Q96PR1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNC2Q96PR1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNC2Q96PR1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNC2Q96PR1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNC2Q96PR1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNC2Q96PR1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNC2Q96PR1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNC2Q96PR1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNC2Q96PR1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNC2Q96PR1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNC2Q96PR1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNC2Q96PR1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNC2Q96PR1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNC2Q96PR1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNC2Q96PR1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNC2Q96PR1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNC2Q96PR1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNC2Q96PR1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNC2Q96PR1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNC2Q96PR1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNC2Q96PR1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNC2Q96PR1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNC2Q96PR1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNC2Q96PR1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms