Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RMDN2Q96LZ7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RMDN2Q96LZ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RMDN2Q96LZ7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RMDN2Q96LZ7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RMDN2Q96LZ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RMDN2Q96LZ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RMDN2Q96LZ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RMDN2Q96LZ7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RMDN2Q96LZ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RMDN2Q96LZ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RMDN2Q96LZ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RMDN2Q96LZ7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RMDN2Q96LZ7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RMDN2Q96LZ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RMDN2Q96LZ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RMDN2Q96LZ7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RMDN2Q96LZ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RMDN2Q96LZ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RMDN2Q96LZ7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RMDN2Q96LZ7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RMDN2Q96LZ7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RMDN2Q96LZ7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RMDN2Q96LZ7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RMDN2Q96LZ7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RMDN2Q96LZ7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RMDN2Q96LZ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RMDN2Q96LZ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RMDN2Q96LZ7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RMDN2Q96LZ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RMDN2Q96LZ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RMDN2Q96LZ7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RMDN2Q96LZ7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RMDN2Q96LZ7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RMDN2Q96LZ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RMDN2Q96LZ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RMDN2Q96LZ7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RMDN2Q96LZ7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RMDN2Q96LZ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RMDN2Q96LZ7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RMDN2Q96LZ7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RMDN2Q96LZ7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RMDN2Q96LZ7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RMDN2Q96LZ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RMDN2Q96LZ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RMDN2Q96LZ7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RMDN2Q96LZ7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RMDN2Q96LZ7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RMDN2Q96LZ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RMDN2Q96LZ7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RMDN2Q96LZ7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RMDN2Q96LZ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RMDN2Q96LZ7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RMDN2Q96LZ7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RMDN2Q96LZ7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RMDN2Q96LZ7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RMDN2Q96LZ7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RMDN2Q96LZ7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RMDN2Q96LZ7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RMDN2Q96LZ7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RMDN2Q96LZ7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RMDN2Q96LZ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RMDN2Q96LZ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RMDN2Q96LZ7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RMDN2Q96LZ7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RMDN2Q96LZ7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RMDN2Q96LZ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RMDN2Q96LZ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RMDN2Q96LZ7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RMDN2Q96LZ7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RMDN2Q96LZ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RMDN2Q96LZ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RMDN2Q96LZ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RMDN2Q96LZ7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RMDN2Q96LZ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RMDN2Q96LZ7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RMDN2Q96LZ7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RMDN2Q96LZ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RMDN2Q96LZ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RMDN2Q96LZ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RMDN2Q96LZ7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RMDN2Q96LZ7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RMDN2Q96LZ7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RMDN2Q96LZ7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RMDN2Q96LZ7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RMDN2Q96LZ7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RMDN2Q96LZ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RMDN2Q96LZ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RMDN2Q96LZ7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RMDN2Q96LZ7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RMDN2Q96LZ7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RMDN2Q96LZ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RMDN2Q96LZ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RMDN2Q96LZ7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RMDN2Q96LZ7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RMDN2Q96LZ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RMDN2Q96LZ7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RMDN2Q96LZ7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RMDN2Q96LZ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RMDN2Q96LZ7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms