Protein–RNA interactions for Protein: Q96KQ4

PPP1R13B, Apoptosis-stimulating of p53 protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R13BQ96KQ4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPP1R13BQ96KQ4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPP1R13BQ96KQ4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PPP1R13BQ96KQ4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP1R13BQ96KQ4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP1R13BQ96KQ4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PPP1R13BQ96KQ4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PPP1R13BQ96KQ4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPP1R13BQ96KQ4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PPP1R13BQ96KQ4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PPP1R13BQ96KQ4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPP1R13BQ96KQ4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPP1R13BQ96KQ4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PPP1R13BQ96KQ4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PPP1R13BQ96KQ4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PPP1R13BQ96KQ4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPP1R13BQ96KQ4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPP1R13BQ96KQ4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPP1R13BQ96KQ4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPP1R13BQ96KQ4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPP1R13BQ96KQ4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPP1R13BQ96KQ4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPP1R13BQ96KQ4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPP1R13BQ96KQ4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPP1R13BQ96KQ4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPP1R13BQ96KQ4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPP1R13BQ96KQ4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPP1R13BQ96KQ4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPP1R13BQ96KQ4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPP1R13BQ96KQ4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPP1R13BQ96KQ4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPP1R13BQ96KQ4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPP1R13BQ96KQ4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPP1R13BQ96KQ4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPP1R13BQ96KQ4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPP1R13BQ96KQ4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPP1R13BQ96KQ4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPP1R13BQ96KQ4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPP1R13BQ96KQ4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPP1R13BQ96KQ4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PPP1R13BQ96KQ4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPP1R13BQ96KQ4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPP1R13BQ96KQ4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPP1R13BQ96KQ4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPP1R13BQ96KQ4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPP1R13BQ96KQ4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPP1R13BQ96KQ4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPP1R13BQ96KQ4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPP1R13BQ96KQ4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPP1R13BQ96KQ4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPP1R13BQ96KQ4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPP1R13BQ96KQ4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPP1R13BQ96KQ4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPP1R13BQ96KQ4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPP1R13BQ96KQ4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PPP1R13BQ96KQ4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPP1R13BQ96KQ4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP1R13BQ96KQ4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP1R13BQ96KQ4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP1R13BQ96KQ4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP1R13BQ96KQ4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP1R13BQ96KQ4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPP1R13BQ96KQ4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPP1R13BQ96KQ4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPP1R13BQ96KQ4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP1R13BQ96KQ4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPP1R13BQ96KQ4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPP1R13BQ96KQ4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPP1R13BQ96KQ4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP1R13BQ96KQ4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP1R13BQ96KQ4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP1R13BQ96KQ4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP1R13BQ96KQ4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP1R13BQ96KQ4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP1R13BQ96KQ4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP1R13BQ96KQ4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP1R13BQ96KQ4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP1R13BQ96KQ4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPP1R13BQ96KQ4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPP1R13BQ96KQ4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPP1R13BQ96KQ4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP1R13BQ96KQ4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPP1R13BQ96KQ4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPP1R13BQ96KQ4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP1R13BQ96KQ4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP1R13BQ96KQ4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP1R13BQ96KQ4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP1R13BQ96KQ4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP1R13BQ96KQ4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP1R13BQ96KQ4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP1R13BQ96KQ4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP1R13BQ96KQ4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP1R13BQ96KQ4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPP1R13BQ96KQ4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPP1R13BQ96KQ4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPP1R13BQ96KQ4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPP1R13BQ96KQ4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPP1R13BQ96KQ4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PPP1R13BQ96KQ4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPP1R13BQ96KQ4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms