Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ6

JPH4, Junctophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH4Q96JJ6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
JPH4Q96JJ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
JPH4Q96JJ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
JPH4Q96JJ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
JPH4Q96JJ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC44.89■■■■■ 4.78
JPH4Q96JJ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC44.89■■■■■ 4.78
JPH4Q96JJ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
JPH4Q96JJ6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
JPH4Q96JJ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
JPH4Q96JJ6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
JPH4Q96JJ6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
JPH4Q96JJ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
JPH4Q96JJ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
JPH4Q96JJ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
JPH4Q96JJ6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
JPH4Q96JJ6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
JPH4Q96JJ6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
JPH4Q96JJ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
JPH4Q96JJ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
JPH4Q96JJ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
JPH4Q96JJ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
JPH4Q96JJ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
JPH4Q96JJ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC44.69■■■■■ 4.74
JPH4Q96JJ6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
JPH4Q96JJ6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC44.66■■■■■ 4.74
JPH4Q96JJ6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC44.63■■■■■ 4.74
JPH4Q96JJ6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
JPH4Q96JJ6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
JPH4Q96JJ6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
JPH4Q96JJ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC44.6■■■■■ 4.73
JPH4Q96JJ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
JPH4Q96JJ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC44.59■■■■■ 4.73
JPH4Q96JJ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
JPH4Q96JJ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
JPH4Q96JJ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
JPH4Q96JJ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
JPH4Q96JJ6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
JPH4Q96JJ6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
JPH4Q96JJ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
JPH4Q96JJ6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
JPH4Q96JJ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC44.51■■■■■ 4.72
JPH4Q96JJ6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
JPH4Q96JJ6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
JPH4Q96JJ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
JPH4Q96JJ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
JPH4Q96JJ6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
JPH4Q96JJ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
JPH4Q96JJ6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC44.46■■■■■ 4.71
JPH4Q96JJ6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC44.46■■■■■ 4.71
JPH4Q96JJ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
JPH4Q96JJ6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
JPH4Q96JJ6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC44.43■■■■■ 4.7
JPH4Q96JJ6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC44.43■■■■■ 4.7
JPH4Q96JJ6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
JPH4Q96JJ6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
JPH4Q96JJ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
JPH4Q96JJ6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC44.39■■■■■ 4.7
JPH4Q96JJ6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
JPH4Q96JJ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
JPH4Q96JJ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
JPH4Q96JJ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
JPH4Q96JJ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
JPH4Q96JJ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
JPH4Q96JJ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
JPH4Q96JJ6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
JPH4Q96JJ6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
JPH4Q96JJ6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
JPH4Q96JJ6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
JPH4Q96JJ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
JPH4Q96JJ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC44.28■■■■■ 4.68
JPH4Q96JJ6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
JPH4Q96JJ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
JPH4Q96JJ6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
JPH4Q96JJ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
JPH4Q96JJ6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
JPH4Q96JJ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
JPH4Q96JJ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
JPH4Q96JJ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
JPH4Q96JJ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
JPH4Q96JJ6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
JPH4Q96JJ6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
JPH4Q96JJ6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
JPH4Q96JJ6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
JPH4Q96JJ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
JPH4Q96JJ6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
JPH4Q96JJ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
JPH4Q96JJ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC44.12■■■■■ 4.65
JPH4Q96JJ6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
JPH4Q96JJ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
JPH4Q96JJ6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC44.08■■■■■ 4.65
JPH4Q96JJ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
JPH4Q96JJ6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
JPH4Q96JJ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
JPH4Q96JJ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
JPH4Q96JJ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.65
JPH4Q96JJ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
JPH4Q96JJ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
JPH4Q96JJ6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
JPH4Q96JJ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
JPH4Q96JJ6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms