Protein–RNA interactions for Protein: Q96FB5

RRNAD1, Protein RRNAD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRNAD1Q96FB5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRNAD1Q96FB5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRNAD1Q96FB5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRNAD1Q96FB5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRNAD1Q96FB5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRNAD1Q96FB5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRNAD1Q96FB5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRNAD1Q96FB5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRNAD1Q96FB5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRNAD1Q96FB5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRNAD1Q96FB5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRNAD1Q96FB5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRNAD1Q96FB5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRNAD1Q96FB5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRNAD1Q96FB5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRNAD1Q96FB5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRNAD1Q96FB5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRNAD1Q96FB5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRNAD1Q96FB5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRNAD1Q96FB5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRNAD1Q96FB5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RRNAD1Q96FB5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRNAD1Q96FB5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRNAD1Q96FB5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRNAD1Q96FB5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRNAD1Q96FB5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRNAD1Q96FB5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRNAD1Q96FB5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRNAD1Q96FB5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRNAD1Q96FB5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRNAD1Q96FB5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRNAD1Q96FB5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRNAD1Q96FB5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRNAD1Q96FB5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRNAD1Q96FB5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRNAD1Q96FB5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRNAD1Q96FB5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRNAD1Q96FB5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRNAD1Q96FB5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRNAD1Q96FB5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRNAD1Q96FB5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRNAD1Q96FB5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRNAD1Q96FB5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRNAD1Q96FB5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRNAD1Q96FB5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRNAD1Q96FB5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRNAD1Q96FB5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRNAD1Q96FB5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRNAD1Q96FB5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRNAD1Q96FB5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRNAD1Q96FB5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRNAD1Q96FB5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRNAD1Q96FB5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRNAD1Q96FB5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRNAD1Q96FB5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRNAD1Q96FB5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRNAD1Q96FB5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRNAD1Q96FB5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRNAD1Q96FB5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRNAD1Q96FB5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRNAD1Q96FB5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRNAD1Q96FB5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRNAD1Q96FB5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRNAD1Q96FB5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRNAD1Q96FB5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRNAD1Q96FB5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRNAD1Q96FB5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RRNAD1Q96FB5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRNAD1Q96FB5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRNAD1Q96FB5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRNAD1Q96FB5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRNAD1Q96FB5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRNAD1Q96FB5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRNAD1Q96FB5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRNAD1Q96FB5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRNAD1Q96FB5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRNAD1Q96FB5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRNAD1Q96FB5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRNAD1Q96FB5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRNAD1Q96FB5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRNAD1Q96FB5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRNAD1Q96FB5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRNAD1Q96FB5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRNAD1Q96FB5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRNAD1Q96FB5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRNAD1Q96FB5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRNAD1Q96FB5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRNAD1Q96FB5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRNAD1Q96FB5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRNAD1Q96FB5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRNAD1Q96FB5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRNAD1Q96FB5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRNAD1Q96FB5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRNAD1Q96FB5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRNAD1Q96FB5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRNAD1Q96FB5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRNAD1Q96FB5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRNAD1Q96FB5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRNAD1Q96FB5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRNAD1Q96FB5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms