Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPDL1Q96EA4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPDL1Q96EA4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPDL1Q96EA4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPDL1Q96EA4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPDL1Q96EA4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPDL1Q96EA4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPDL1Q96EA4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPDL1Q96EA4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SPDL1Q96EA4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPDL1Q96EA4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPDL1Q96EA4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPDL1Q96EA4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPDL1Q96EA4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPDL1Q96EA4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPDL1Q96EA4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPDL1Q96EA4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPDL1Q96EA4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPDL1Q96EA4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPDL1Q96EA4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPDL1Q96EA4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPDL1Q96EA4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPDL1Q96EA4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPDL1Q96EA4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPDL1Q96EA4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPDL1Q96EA4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPDL1Q96EA4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPDL1Q96EA4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPDL1Q96EA4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPDL1Q96EA4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPDL1Q96EA4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPDL1Q96EA4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPDL1Q96EA4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPDL1Q96EA4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPDL1Q96EA4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPDL1Q96EA4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPDL1Q96EA4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPDL1Q96EA4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPDL1Q96EA4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPDL1Q96EA4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPDL1Q96EA4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPDL1Q96EA4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPDL1Q96EA4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPDL1Q96EA4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPDL1Q96EA4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPDL1Q96EA4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPDL1Q96EA4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPDL1Q96EA4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPDL1Q96EA4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPDL1Q96EA4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPDL1Q96EA4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPDL1Q96EA4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPDL1Q96EA4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPDL1Q96EA4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPDL1Q96EA4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPDL1Q96EA4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPDL1Q96EA4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPDL1Q96EA4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPDL1Q96EA4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPDL1Q96EA4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPDL1Q96EA4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPDL1Q96EA4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPDL1Q96EA4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SPDL1Q96EA4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPDL1Q96EA4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPDL1Q96EA4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPDL1Q96EA4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPDL1Q96EA4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPDL1Q96EA4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPDL1Q96EA4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPDL1Q96EA4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPDL1Q96EA4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPDL1Q96EA4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPDL1Q96EA4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SPDL1Q96EA4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPDL1Q96EA4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPDL1Q96EA4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPDL1Q96EA4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPDL1Q96EA4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPDL1Q96EA4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPDL1Q96EA4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPDL1Q96EA4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPDL1Q96EA4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDL1Q96EA4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDL1Q96EA4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDL1Q96EA4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPDL1Q96EA4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDL1Q96EA4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPDL1Q96EA4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SPDL1Q96EA4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPDL1Q96EA4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPDL1Q96EA4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPDL1Q96EA4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPDL1Q96EA4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDL1Q96EA4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDL1Q96EA4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDL1Q96EA4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPDL1Q96EA4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPDL1Q96EA4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPDL1Q96EA4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 786.7 ms