Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBGCP3Q96CW5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBGCP3Q96CW5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBGCP3Q96CW5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBGCP3Q96CW5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP3Q96CW5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP3Q96CW5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBGCP3Q96CW5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBGCP3Q96CW5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBGCP3Q96CW5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBGCP3Q96CW5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBGCP3Q96CW5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBGCP3Q96CW5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBGCP3Q96CW5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBGCP3Q96CW5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBGCP3Q96CW5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBGCP3Q96CW5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TUBGCP3Q96CW5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP3Q96CW5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP3Q96CW5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP3Q96CW5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBGCP3Q96CW5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBGCP3Q96CW5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBGCP3Q96CW5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP3Q96CW5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP3Q96CW5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP3Q96CW5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP3Q96CW5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP3Q96CW5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBGCP3Q96CW5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBGCP3Q96CW5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP3Q96CW5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP3Q96CW5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP3Q96CW5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP3Q96CW5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP3Q96CW5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP3Q96CW5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBGCP3Q96CW5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBGCP3Q96CW5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBGCP3Q96CW5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBGCP3Q96CW5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP3Q96CW5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP3Q96CW5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TUBGCP3Q96CW5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP3Q96CW5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP3Q96CW5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP3Q96CW5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP3Q96CW5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP3Q96CW5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP3Q96CW5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP3Q96CW5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP3Q96CW5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP3Q96CW5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP3Q96CW5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP3Q96CW5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP3Q96CW5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TUBGCP3Q96CW5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBGCP3Q96CW5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBGCP3Q96CW5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 281.9 ms