Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRAMD1AQ96CP6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRAMD1AQ96CP6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRAMD1AQ96CP6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GRAMD1AQ96CP6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRAMD1AQ96CP6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GRAMD1AQ96CP6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRAMD1AQ96CP6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRAMD1AQ96CP6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRAMD1AQ96CP6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRAMD1AQ96CP6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRAMD1AQ96CP6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRAMD1AQ96CP6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRAMD1AQ96CP6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GRAMD1AQ96CP6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRAMD1AQ96CP6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRAMD1AQ96CP6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRAMD1AQ96CP6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRAMD1AQ96CP6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRAMD1AQ96CP6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GRAMD1AQ96CP6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GRAMD1AQ96CP6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRAMD1AQ96CP6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GRAMD1AQ96CP6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRAMD1AQ96CP6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GRAMD1AQ96CP6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRAMD1AQ96CP6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRAMD1AQ96CP6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRAMD1AQ96CP6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRAMD1AQ96CP6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRAMD1AQ96CP6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRAMD1AQ96CP6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRAMD1AQ96CP6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRAMD1AQ96CP6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRAMD1AQ96CP6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRAMD1AQ96CP6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRAMD1AQ96CP6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRAMD1AQ96CP6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRAMD1AQ96CP6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GRAMD1AQ96CP6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRAMD1AQ96CP6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRAMD1AQ96CP6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRAMD1AQ96CP6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRAMD1AQ96CP6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRAMD1AQ96CP6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRAMD1AQ96CP6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRAMD1AQ96CP6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRAMD1AQ96CP6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRAMD1AQ96CP6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRAMD1AQ96CP6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRAMD1AQ96CP6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRAMD1AQ96CP6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRAMD1AQ96CP6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRAMD1AQ96CP6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRAMD1AQ96CP6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRAMD1AQ96CP6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRAMD1AQ96CP6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRAMD1AQ96CP6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRAMD1AQ96CP6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GRAMD1AQ96CP6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRAMD1AQ96CP6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRAMD1AQ96CP6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRAMD1AQ96CP6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRAMD1AQ96CP6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRAMD1AQ96CP6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRAMD1AQ96CP6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRAMD1AQ96CP6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRAMD1AQ96CP6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRAMD1AQ96CP6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRAMD1AQ96CP6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRAMD1AQ96CP6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRAMD1AQ96CP6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GRAMD1AQ96CP6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRAMD1AQ96CP6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRAMD1AQ96CP6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRAMD1AQ96CP6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRAMD1AQ96CP6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRAMD1AQ96CP6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRAMD1AQ96CP6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRAMD1AQ96CP6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRAMD1AQ96CP6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRAMD1AQ96CP6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRAMD1AQ96CP6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRAMD1AQ96CP6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRAMD1AQ96CP6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRAMD1AQ96CP6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRAMD1AQ96CP6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRAMD1AQ96CP6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRAMD1AQ96CP6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRAMD1AQ96CP6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRAMD1AQ96CP6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRAMD1AQ96CP6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRAMD1AQ96CP6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRAMD1AQ96CP6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRAMD1AQ96CP6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRAMD1AQ96CP6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GRAMD1AQ96CP6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GRAMD1AQ96CP6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRAMD1AQ96CP6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms