Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ULK4Q96C45 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ULK4Q96C45 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ULK4Q96C45 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ULK4Q96C45 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ULK4Q96C45 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ULK4Q96C45 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ULK4Q96C45 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ULK4Q96C45 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ULK4Q96C45 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ULK4Q96C45 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ULK4Q96C45 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ULK4Q96C45 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ULK4Q96C45 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ULK4Q96C45 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ULK4Q96C45 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ULK4Q96C45 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ULK4Q96C45 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ULK4Q96C45 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ULK4Q96C45 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ULK4Q96C45 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ULK4Q96C45 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ULK4Q96C45 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ULK4Q96C45 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ULK4Q96C45 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ULK4Q96C45 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ULK4Q96C45 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ULK4Q96C45 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ULK4Q96C45 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ULK4Q96C45 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ULK4Q96C45 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ULK4Q96C45 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ULK4Q96C45 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ULK4Q96C45 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ULK4Q96C45 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ULK4Q96C45 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ULK4Q96C45 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ULK4Q96C45 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ULK4Q96C45 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ULK4Q96C45 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ULK4Q96C45 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ULK4Q96C45 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ULK4Q96C45 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ULK4Q96C45 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ULK4Q96C45 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ULK4Q96C45 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ULK4Q96C45 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ULK4Q96C45 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ULK4Q96C45 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ULK4Q96C45 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ULK4Q96C45 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ULK4Q96C45 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ULK4Q96C45 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ULK4Q96C45 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ULK4Q96C45 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ULK4Q96C45 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ULK4Q96C45 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ULK4Q96C45 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ULK4Q96C45 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ULK4Q96C45 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ULK4Q96C45 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ULK4Q96C45 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ULK4Q96C45 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ULK4Q96C45 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ULK4Q96C45 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ULK4Q96C45 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ULK4Q96C45 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ULK4Q96C45 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ULK4Q96C45 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ULK4Q96C45 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ULK4Q96C45 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms