Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHD2Q96C19 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFHD2Q96C19 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFHD2Q96C19 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFHD2Q96C19 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFHD2Q96C19 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFHD2Q96C19 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFHD2Q96C19 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFHD2Q96C19 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHD2Q96C19 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHD2Q96C19 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHD2Q96C19 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHD2Q96C19 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFHD2Q96C19 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFHD2Q96C19 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFHD2Q96C19 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFHD2Q96C19 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFHD2Q96C19 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFHD2Q96C19 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFHD2Q96C19 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFHD2Q96C19 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFHD2Q96C19 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFHD2Q96C19 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EFHD2Q96C19 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFHD2Q96C19 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFHD2Q96C19 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFHD2Q96C19 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFHD2Q96C19 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFHD2Q96C19 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFHD2Q96C19 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFHD2Q96C19 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFHD2Q96C19 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFHD2Q96C19 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFHD2Q96C19 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFHD2Q96C19 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFHD2Q96C19 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFHD2Q96C19 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EFHD2Q96C19 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EFHD2Q96C19 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EFHD2Q96C19 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EFHD2Q96C19 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFHD2Q96C19 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFHD2Q96C19 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFHD2Q96C19 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFHD2Q96C19 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFHD2Q96C19 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EFHD2Q96C19 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFHD2Q96C19 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFHD2Q96C19 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFHD2Q96C19 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHD2Q96C19 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHD2Q96C19 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHD2Q96C19 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EFHD2Q96C19 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFHD2Q96C19 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHD2Q96C19 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFHD2Q96C19 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFHD2Q96C19 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFHD2Q96C19 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFHD2Q96C19 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFHD2Q96C19 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHD2Q96C19 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHD2Q96C19 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFHD2Q96C19 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFHD2Q96C19 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFHD2Q96C19 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFHD2Q96C19 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFHD2Q96C19 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFHD2Q96C19 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFHD2Q96C19 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFHD2Q96C19 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFHD2Q96C19 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EFHD2Q96C19 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFHD2Q96C19 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFHD2Q96C19 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFHD2Q96C19 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFHD2Q96C19 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFHD2Q96C19 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHD2Q96C19 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHD2Q96C19 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFHD2Q96C19 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFHD2Q96C19 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EFHD2Q96C19 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFHD2Q96C19 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFHD2Q96C19 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFHD2Q96C19 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EFHD2Q96C19 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFHD2Q96C19 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFHD2Q96C19 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFHD2Q96C19 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFHD2Q96C19 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFHD2Q96C19 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFHD2Q96C19 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFHD2Q96C19 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFHD2Q96C19 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFHD2Q96C19 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFHD2Q96C19 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFHD2Q96C19 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFHD2Q96C19 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFHD2Q96C19 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms