Protein–RNA interactions for Protein: Q96B86

RGMA, Repulsive guidance molecule A, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMAQ96B86 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGMAQ96B86 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGMAQ96B86 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGMAQ96B86 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGMAQ96B86 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGMAQ96B86 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGMAQ96B86 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGMAQ96B86 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGMAQ96B86 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGMAQ96B86 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RGMAQ96B86 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGMAQ96B86 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGMAQ96B86 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGMAQ96B86 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGMAQ96B86 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGMAQ96B86 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGMAQ96B86 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGMAQ96B86 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGMAQ96B86 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGMAQ96B86 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGMAQ96B86 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGMAQ96B86 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGMAQ96B86 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGMAQ96B86 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGMAQ96B86 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGMAQ96B86 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RGMAQ96B86 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGMAQ96B86 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGMAQ96B86 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGMAQ96B86 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGMAQ96B86 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGMAQ96B86 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGMAQ96B86 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGMAQ96B86 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RGMAQ96B86 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RGMAQ96B86 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGMAQ96B86 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGMAQ96B86 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RGMAQ96B86 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGMAQ96B86 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RGMAQ96B86 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGMAQ96B86 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RGMAQ96B86 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGMAQ96B86 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGMAQ96B86 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RGMAQ96B86 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RGMAQ96B86 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RGMAQ96B86 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RGMAQ96B86 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGMAQ96B86 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGMAQ96B86 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGMAQ96B86 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGMAQ96B86 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGMAQ96B86 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGMAQ96B86 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RGMAQ96B86 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGMAQ96B86 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGMAQ96B86 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGMAQ96B86 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGMAQ96B86 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGMAQ96B86 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGMAQ96B86 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RGMAQ96B86 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGMAQ96B86 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGMAQ96B86 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGMAQ96B86 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGMAQ96B86 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGMAQ96B86 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGMAQ96B86 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGMAQ96B86 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGMAQ96B86 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGMAQ96B86 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGMAQ96B86 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMAQ96B86 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMAQ96B86 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMAQ96B86 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RGMAQ96B86 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGMAQ96B86 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGMAQ96B86 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms