Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP9XQ93008 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP9XQ93008 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP9XQ93008 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP9XQ93008 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP9XQ93008 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP9XQ93008 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP9XQ93008 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP9XQ93008 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP9XQ93008 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP9XQ93008 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP9XQ93008 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP9XQ93008 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP9XQ93008 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP9XQ93008 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP9XQ93008 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP9XQ93008 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP9XQ93008 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP9XQ93008 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP9XQ93008 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP9XQ93008 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP9XQ93008 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP9XQ93008 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP9XQ93008 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP9XQ93008 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP9XQ93008 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP9XQ93008 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP9XQ93008 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP9XQ93008 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP9XQ93008 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP9XQ93008 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP9XQ93008 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP9XQ93008 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP9XQ93008 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP9XQ93008 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP9XQ93008 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP9XQ93008 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP9XQ93008 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP9XQ93008 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP9XQ93008 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP9XQ93008 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP9XQ93008 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP9XQ93008 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP9XQ93008 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP9XQ93008 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP9XQ93008 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP9XQ93008 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP9XQ93008 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP9XQ93008 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP9XQ93008 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP9XQ93008 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP9XQ93008 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP9XQ93008 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP9XQ93008 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP9XQ93008 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP9XQ93008 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP9XQ93008 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP9XQ93008 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP9XQ93008 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP9XQ93008 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP9XQ93008 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP9XQ93008 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP9XQ93008 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP9XQ93008 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP9XQ93008 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP9XQ93008 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP9XQ93008 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP9XQ93008 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP9XQ93008 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP9XQ93008 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP9XQ93008 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP9XQ93008 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP9XQ93008 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP9XQ93008 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP9XQ93008 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP9XQ93008 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP9XQ93008 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP9XQ93008 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP9XQ93008 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP9XQ93008 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP9XQ93008 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP9XQ93008 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP9XQ93008 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP9XQ93008 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP9XQ93008 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP9XQ93008 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP9XQ93008 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP9XQ93008 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP9XQ93008 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP9XQ93008 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP9XQ93008 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP9XQ93008 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP9XQ93008 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP9XQ93008 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP9XQ93008 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP9XQ93008 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP9XQ93008 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP9XQ93008 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP9XQ93008 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP9XQ93008 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms