Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA9

SREK1, Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1Q8WXA9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SREK1Q8WXA9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SREK1Q8WXA9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SREK1Q8WXA9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SREK1Q8WXA9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SREK1Q8WXA9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SREK1Q8WXA9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SREK1Q8WXA9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SREK1Q8WXA9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SREK1Q8WXA9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SREK1Q8WXA9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SREK1Q8WXA9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SREK1Q8WXA9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SREK1Q8WXA9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SREK1Q8WXA9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SREK1Q8WXA9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SREK1Q8WXA9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SREK1Q8WXA9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SREK1Q8WXA9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SREK1Q8WXA9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SREK1Q8WXA9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SREK1Q8WXA9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SREK1Q8WXA9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SREK1Q8WXA9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SREK1Q8WXA9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SREK1Q8WXA9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SREK1Q8WXA9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SREK1Q8WXA9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SREK1Q8WXA9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SREK1Q8WXA9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SREK1Q8WXA9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SREK1Q8WXA9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SREK1Q8WXA9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SREK1Q8WXA9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SREK1Q8WXA9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SREK1Q8WXA9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SREK1Q8WXA9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SREK1Q8WXA9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SREK1Q8WXA9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SREK1Q8WXA9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SREK1Q8WXA9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SREK1Q8WXA9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SREK1Q8WXA9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SREK1Q8WXA9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SREK1Q8WXA9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SREK1Q8WXA9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SREK1Q8WXA9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SREK1Q8WXA9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SREK1Q8WXA9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SREK1Q8WXA9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SREK1Q8WXA9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SREK1Q8WXA9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SREK1Q8WXA9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SREK1Q8WXA9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SREK1Q8WXA9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SREK1Q8WXA9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SREK1Q8WXA9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREK1Q8WXA9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREK1Q8WXA9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREK1Q8WXA9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SREK1Q8WXA9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SREK1Q8WXA9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SREK1Q8WXA9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SREK1Q8WXA9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SREK1Q8WXA9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SREK1Q8WXA9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SREK1Q8WXA9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SREK1Q8WXA9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SREK1Q8WXA9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SREK1Q8WXA9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREK1Q8WXA9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SREK1Q8WXA9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SREK1Q8WXA9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SREK1Q8WXA9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SREK1Q8WXA9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREK1Q8WXA9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREK1Q8WXA9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREK1Q8WXA9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SREK1Q8WXA9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SREK1Q8WXA9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SREK1Q8WXA9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SREK1Q8WXA9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SREK1Q8WXA9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREK1Q8WXA9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREK1Q8WXA9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREK1Q8WXA9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SREK1Q8WXA9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SREK1Q8WXA9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SREK1Q8WXA9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SREK1Q8WXA9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREK1Q8WXA9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREK1Q8WXA9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SREK1Q8WXA9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SREK1Q8WXA9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SREK1Q8WXA9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREK1Q8WXA9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREK1Q8WXA9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SREK1Q8WXA9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SREK1Q8WXA9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SREK1Q8WXA9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms