Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PALLDQ8WX93 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PALLDQ8WX93 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PALLDQ8WX93 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PALLDQ8WX93 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PALLDQ8WX93 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PALLDQ8WX93 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PALLDQ8WX93 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
PALLDQ8WX93 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PALLDQ8WX93 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PALLDQ8WX93 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PALLDQ8WX93 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PALLDQ8WX93 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PALLDQ8WX93 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PALLDQ8WX93 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PALLDQ8WX93 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PALLDQ8WX93 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PALLDQ8WX93 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PALLDQ8WX93 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PALLDQ8WX93 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PALLDQ8WX93 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PALLDQ8WX93 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PALLDQ8WX93 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PALLDQ8WX93 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PALLDQ8WX93 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PALLDQ8WX93 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PALLDQ8WX93 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PALLDQ8WX93 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PALLDQ8WX93 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PALLDQ8WX93 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PALLDQ8WX93 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PALLDQ8WX93 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PALLDQ8WX93 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PALLDQ8WX93 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PALLDQ8WX93 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PALLDQ8WX93 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PALLDQ8WX93 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PALLDQ8WX93 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PALLDQ8WX93 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PALLDQ8WX93 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PALLDQ8WX93 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PALLDQ8WX93 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PALLDQ8WX93 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PALLDQ8WX93 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PALLDQ8WX93 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
PALLDQ8WX93 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PALLDQ8WX93 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PALLDQ8WX93 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PALLDQ8WX93 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PALLDQ8WX93 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PALLDQ8WX93 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PALLDQ8WX93 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PALLDQ8WX93 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
PALLDQ8WX93 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PALLDQ8WX93 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PALLDQ8WX93 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PALLDQ8WX93 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PALLDQ8WX93 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PALLDQ8WX93 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
PALLDQ8WX93 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PALLDQ8WX93 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PALLDQ8WX93 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PALLDQ8WX93 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
PALLDQ8WX93 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PALLDQ8WX93 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PALLDQ8WX93 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PALLDQ8WX93 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PALLDQ8WX93 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PALLDQ8WX93 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PALLDQ8WX93 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PALLDQ8WX93 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PALLDQ8WX93 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PALLDQ8WX93 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PALLDQ8WX93 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PALLDQ8WX93 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PALLDQ8WX93 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PALLDQ8WX93 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PALLDQ8WX93 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PALLDQ8WX93 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PALLDQ8WX93 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PALLDQ8WX93 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PALLDQ8WX93 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PALLDQ8WX93 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PALLDQ8WX93 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PALLDQ8WX93 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PALLDQ8WX93 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PALLDQ8WX93 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
PALLDQ8WX93 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
PALLDQ8WX93 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
PALLDQ8WX93 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PALLDQ8WX93 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PALLDQ8WX93 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
PALLDQ8WX93 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PALLDQ8WX93 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PALLDQ8WX93 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PALLDQ8WX93 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PALLDQ8WX93 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PALLDQ8WX93 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PALLDQ8WX93 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PALLDQ8WX93 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms