Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC107Q8WV48 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC107Q8WV48 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC107Q8WV48 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC107Q8WV48 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC107Q8WV48 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC107Q8WV48 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC107Q8WV48 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC107Q8WV48 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC107Q8WV48 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC107Q8WV48 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC107Q8WV48 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC107Q8WV48 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC107Q8WV48 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC107Q8WV48 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC107Q8WV48 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC107Q8WV48 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC107Q8WV48 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC107Q8WV48 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC107Q8WV48 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC107Q8WV48 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC107Q8WV48 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC107Q8WV48 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC107Q8WV48 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC107Q8WV48 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC107Q8WV48 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC107Q8WV48 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC107Q8WV48 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC107Q8WV48 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC107Q8WV48 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC107Q8WV48 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC107Q8WV48 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC107Q8WV48 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC107Q8WV48 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC107Q8WV48 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC107Q8WV48 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC107Q8WV48 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC107Q8WV48 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC107Q8WV48 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC107Q8WV48 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC107Q8WV48 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC107Q8WV48 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC107Q8WV48 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC107Q8WV48 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC107Q8WV48 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC107Q8WV48 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC107Q8WV48 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC107Q8WV48 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC107Q8WV48 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC107Q8WV48 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC107Q8WV48 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC107Q8WV48 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC107Q8WV48 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC107Q8WV48 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC107Q8WV48 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC107Q8WV48 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC107Q8WV48 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC107Q8WV48 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC107Q8WV48 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC107Q8WV48 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC107Q8WV48 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC107Q8WV48 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC107Q8WV48 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC107Q8WV48 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC107Q8WV48 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC107Q8WV48 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC107Q8WV48 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC107Q8WV48 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC107Q8WV48 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC107Q8WV48 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC107Q8WV48 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC107Q8WV48 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC107Q8WV48 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC107Q8WV48 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC107Q8WV48 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC107Q8WV48 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC107Q8WV48 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC107Q8WV48 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC107Q8WV48 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC107Q8WV48 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC107Q8WV48 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC107Q8WV48 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC107Q8WV48 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC107Q8WV48 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC107Q8WV48 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC107Q8WV48 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC107Q8WV48 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC107Q8WV48 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC107Q8WV48 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC107Q8WV48 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC107Q8WV48 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC107Q8WV48 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC107Q8WV48 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC107Q8WV48 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC107Q8WV48 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC107Q8WV48 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC107Q8WV48 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC107Q8WV48 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC107Q8WV48 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC107Q8WV48 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms