Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU58

FAM222B, Protein FAM222B, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM222BQ8WU58 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM222BQ8WU58 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM222BQ8WU58 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM222BQ8WU58 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM222BQ8WU58 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM222BQ8WU58 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM222BQ8WU58 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM222BQ8WU58 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM222BQ8WU58 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM222BQ8WU58 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM222BQ8WU58 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM222BQ8WU58 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM222BQ8WU58 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM222BQ8WU58 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM222BQ8WU58 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM222BQ8WU58 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM222BQ8WU58 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM222BQ8WU58 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM222BQ8WU58 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM222BQ8WU58 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM222BQ8WU58 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM222BQ8WU58 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM222BQ8WU58 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM222BQ8WU58 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM222BQ8WU58 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM222BQ8WU58 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM222BQ8WU58 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM222BQ8WU58 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM222BQ8WU58 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM222BQ8WU58 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM222BQ8WU58 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM222BQ8WU58 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM222BQ8WU58 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM222BQ8WU58 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM222BQ8WU58 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM222BQ8WU58 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM222BQ8WU58 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM222BQ8WU58 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM222BQ8WU58 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM222BQ8WU58 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM222BQ8WU58 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM222BQ8WU58 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM222BQ8WU58 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM222BQ8WU58 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM222BQ8WU58 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM222BQ8WU58 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM222BQ8WU58 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM222BQ8WU58 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM222BQ8WU58 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM222BQ8WU58 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM222BQ8WU58 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM222BQ8WU58 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM222BQ8WU58 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM222BQ8WU58 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM222BQ8WU58 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM222BQ8WU58 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM222BQ8WU58 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM222BQ8WU58 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM222BQ8WU58 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM222BQ8WU58 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM222BQ8WU58 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM222BQ8WU58 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM222BQ8WU58 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM222BQ8WU58 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM222BQ8WU58 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM222BQ8WU58 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM222BQ8WU58 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM222BQ8WU58 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM222BQ8WU58 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM222BQ8WU58 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM222BQ8WU58 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM222BQ8WU58 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM222BQ8WU58 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM222BQ8WU58 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM222BQ8WU58 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM222BQ8WU58 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms