Protein–RNA interactions for Protein: Q8TER0

SNED1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNED1Q8TER0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNED1Q8TER0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNED1Q8TER0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNED1Q8TER0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNED1Q8TER0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
SNED1Q8TER0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SNED1Q8TER0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SNED1Q8TER0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SNED1Q8TER0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SNED1Q8TER0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNED1Q8TER0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNED1Q8TER0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNED1Q8TER0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SNED1Q8TER0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNED1Q8TER0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNED1Q8TER0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNED1Q8TER0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNED1Q8TER0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNED1Q8TER0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNED1Q8TER0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SNED1Q8TER0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SNED1Q8TER0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SNED1Q8TER0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SNED1Q8TER0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SNED1Q8TER0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SNED1Q8TER0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SNED1Q8TER0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SNED1Q8TER0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SNED1Q8TER0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SNED1Q8TER0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SNED1Q8TER0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SNED1Q8TER0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SNED1Q8TER0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SNED1Q8TER0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SNED1Q8TER0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SNED1Q8TER0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SNED1Q8TER0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SNED1Q8TER0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SNED1Q8TER0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNED1Q8TER0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNED1Q8TER0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNED1Q8TER0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SNED1Q8TER0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SNED1Q8TER0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
SNED1Q8TER0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SNED1Q8TER0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SNED1Q8TER0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SNED1Q8TER0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SNED1Q8TER0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SNED1Q8TER0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SNED1Q8TER0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SNED1Q8TER0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms