Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR2

STK35, Serine/threonine-protein kinase 35, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STK35Q8TDR2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STK35Q8TDR2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STK35Q8TDR2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STK35Q8TDR2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STK35Q8TDR2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STK35Q8TDR2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STK35Q8TDR2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
STK35Q8TDR2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STK35Q8TDR2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
STK35Q8TDR2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STK35Q8TDR2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STK35Q8TDR2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STK35Q8TDR2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STK35Q8TDR2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STK35Q8TDR2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STK35Q8TDR2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STK35Q8TDR2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STK35Q8TDR2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STK35Q8TDR2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STK35Q8TDR2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STK35Q8TDR2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STK35Q8TDR2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STK35Q8TDR2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STK35Q8TDR2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STK35Q8TDR2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STK35Q8TDR2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STK35Q8TDR2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STK35Q8TDR2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STK35Q8TDR2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STK35Q8TDR2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STK35Q8TDR2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STK35Q8TDR2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STK35Q8TDR2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STK35Q8TDR2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STK35Q8TDR2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STK35Q8TDR2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STK35Q8TDR2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STK35Q8TDR2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STK35Q8TDR2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STK35Q8TDR2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STK35Q8TDR2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STK35Q8TDR2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STK35Q8TDR2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STK35Q8TDR2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STK35Q8TDR2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STK35Q8TDR2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STK35Q8TDR2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STK35Q8TDR2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STK35Q8TDR2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STK35Q8TDR2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STK35Q8TDR2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STK35Q8TDR2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STK35Q8TDR2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STK35Q8TDR2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STK35Q8TDR2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STK35Q8TDR2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STK35Q8TDR2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STK35Q8TDR2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STK35Q8TDR2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STK35Q8TDR2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STK35Q8TDR2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STK35Q8TDR2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STK35Q8TDR2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STK35Q8TDR2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STK35Q8TDR2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STK35Q8TDR2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STK35Q8TDR2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STK35Q8TDR2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STK35Q8TDR2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STK35Q8TDR2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
STK35Q8TDR2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STK35Q8TDR2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STK35Q8TDR2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STK35Q8TDR2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STK35Q8TDR2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STK35Q8TDR2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STK35Q8TDR2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STK35Q8TDR2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STK35Q8TDR2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STK35Q8TDR2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STK35Q8TDR2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms