Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG0

FAM71C, Protein FAM71C, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71CQ8NEG0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71CQ8NEG0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM71CQ8NEG0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM71CQ8NEG0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71CQ8NEG0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71CQ8NEG0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM71CQ8NEG0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM71CQ8NEG0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71CQ8NEG0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71CQ8NEG0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71CQ8NEG0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71CQ8NEG0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71CQ8NEG0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71CQ8NEG0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71CQ8NEG0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71CQ8NEG0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM71CQ8NEG0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM71CQ8NEG0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM71CQ8NEG0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71CQ8NEG0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71CQ8NEG0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71CQ8NEG0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71CQ8NEG0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71CQ8NEG0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71CQ8NEG0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71CQ8NEG0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71CQ8NEG0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71CQ8NEG0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71CQ8NEG0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71CQ8NEG0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71CQ8NEG0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71CQ8NEG0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71CQ8NEG0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71CQ8NEG0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71CQ8NEG0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71CQ8NEG0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM71CQ8NEG0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM71CQ8NEG0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71CQ8NEG0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71CQ8NEG0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71CQ8NEG0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71CQ8NEG0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71CQ8NEG0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71CQ8NEG0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM71CQ8NEG0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM71CQ8NEG0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM71CQ8NEG0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71CQ8NEG0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71CQ8NEG0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71CQ8NEG0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71CQ8NEG0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71CQ8NEG0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71CQ8NEG0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71CQ8NEG0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71CQ8NEG0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71CQ8NEG0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71CQ8NEG0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71CQ8NEG0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71CQ8NEG0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71CQ8NEG0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71CQ8NEG0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM71CQ8NEG0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM71CQ8NEG0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM71CQ8NEG0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM71CQ8NEG0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM71CQ8NEG0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM71CQ8NEG0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM71CQ8NEG0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM71CQ8NEG0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM71CQ8NEG0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM71CQ8NEG0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM71CQ8NEG0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM71CQ8NEG0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM71CQ8NEG0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM71CQ8NEG0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM71CQ8NEG0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM71CQ8NEG0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms