Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIPK4Q8NE63 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIPK4Q8NE63 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIPK4Q8NE63 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIPK4Q8NE63 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIPK4Q8NE63 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HIPK4Q8NE63 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIPK4Q8NE63 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIPK4Q8NE63 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIPK4Q8NE63 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIPK4Q8NE63 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIPK4Q8NE63 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIPK4Q8NE63 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIPK4Q8NE63 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HIPK4Q8NE63 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
HIPK4Q8NE63 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIPK4Q8NE63 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIPK4Q8NE63 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIPK4Q8NE63 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIPK4Q8NE63 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIPK4Q8NE63 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIPK4Q8NE63 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIPK4Q8NE63 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIPK4Q8NE63 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIPK4Q8NE63 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIPK4Q8NE63 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIPK4Q8NE63 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIPK4Q8NE63 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HIPK4Q8NE63 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIPK4Q8NE63 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIPK4Q8NE63 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIPK4Q8NE63 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIPK4Q8NE63 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HIPK4Q8NE63 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HIPK4Q8NE63 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIPK4Q8NE63 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HIPK4Q8NE63 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIPK4Q8NE63 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIPK4Q8NE63 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HIPK4Q8NE63 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIPK4Q8NE63 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HIPK4Q8NE63 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIPK4Q8NE63 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIPK4Q8NE63 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIPK4Q8NE63 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HIPK4Q8NE63 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIPK4Q8NE63 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HIPK4Q8NE63 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HIPK4Q8NE63 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIPK4Q8NE63 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HIPK4Q8NE63 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HIPK4Q8NE63 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HIPK4Q8NE63 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HIPK4Q8NE63 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HIPK4Q8NE63 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HIPK4Q8NE63 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIPK4Q8NE63 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HIPK4Q8NE63 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIPK4Q8NE63 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIPK4Q8NE63 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIPK4Q8NE63 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HIPK4Q8NE63 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIPK4Q8NE63 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIPK4Q8NE63 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HIPK4Q8NE63 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIPK4Q8NE63 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIPK4Q8NE63 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIPK4Q8NE63 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIPK4Q8NE63 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HIPK4Q8NE63 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIPK4Q8NE63 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIPK4Q8NE63 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIPK4Q8NE63 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIPK4Q8NE63 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HIPK4Q8NE63 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIPK4Q8NE63 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIPK4Q8NE63 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIPK4Q8NE63 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIPK4Q8NE63 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIPK4Q8NE63 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIPK4Q8NE63 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIPK4Q8NE63 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIPK4Q8NE63 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIPK4Q8NE63 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIPK4Q8NE63 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIPK4Q8NE63 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIPK4Q8NE63 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIPK4Q8NE63 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIPK4Q8NE63 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIPK4Q8NE63 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIPK4Q8NE63 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIPK4Q8NE63 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIPK4Q8NE63 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIPK4Q8NE63 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HIPK4Q8NE63 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIPK4Q8NE63 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIPK4Q8NE63 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIPK4Q8NE63 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIPK4Q8NE63 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIPK4Q8NE63 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms