Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHST4Q8NCG5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHST4Q8NCG5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST4Q8NCG5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST4Q8NCG5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST4Q8NCG5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST4Q8NCG5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST4Q8NCG5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST4Q8NCG5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST4Q8NCG5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST4Q8NCG5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST4Q8NCG5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST4Q8NCG5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST4Q8NCG5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST4Q8NCG5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST4Q8NCG5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST4Q8NCG5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST4Q8NCG5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST4Q8NCG5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST4Q8NCG5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CHST4Q8NCG5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST4Q8NCG5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST4Q8NCG5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST4Q8NCG5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST4Q8NCG5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST4Q8NCG5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST4Q8NCG5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST4Q8NCG5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST4Q8NCG5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST4Q8NCG5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST4Q8NCG5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST4Q8NCG5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST4Q8NCG5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST4Q8NCG5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST4Q8NCG5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST4Q8NCG5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST4Q8NCG5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST4Q8NCG5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST4Q8NCG5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST4Q8NCG5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST4Q8NCG5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST4Q8NCG5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST4Q8NCG5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST4Q8NCG5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST4Q8NCG5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHST4Q8NCG5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST4Q8NCG5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST4Q8NCG5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST4Q8NCG5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST4Q8NCG5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST4Q8NCG5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST4Q8NCG5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST4Q8NCG5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST4Q8NCG5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST4Q8NCG5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST4Q8NCG5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHST4Q8NCG5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHST4Q8NCG5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST4Q8NCG5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST4Q8NCG5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST4Q8NCG5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST4Q8NCG5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST4Q8NCG5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST4Q8NCG5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST4Q8NCG5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST4Q8NCG5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST4Q8NCG5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST4Q8NCG5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST4Q8NCG5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST4Q8NCG5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST4Q8NCG5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST4Q8NCG5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST4Q8NCG5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHST4Q8NCG5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHST4Q8NCG5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST4Q8NCG5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST4Q8NCG5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST4Q8NCG5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST4Q8NCG5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST4Q8NCG5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST4Q8NCG5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST4Q8NCG5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST4Q8NCG5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST4Q8NCG5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST4Q8NCG5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST4Q8NCG5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST4Q8NCG5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST4Q8NCG5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST4Q8NCG5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHST4Q8NCG5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHST4Q8NCG5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHST4Q8NCG5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHST4Q8NCG5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST4Q8NCG5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST4Q8NCG5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST4Q8NCG5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST4Q8NCG5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST4Q8NCG5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST4Q8NCG5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST4Q8NCG5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms