Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COLGALT1Q8NBJ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
COLGALT1Q8NBJ5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
COLGALT1Q8NBJ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COLGALT1Q8NBJ5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COLGALT1Q8NBJ5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COLGALT1Q8NBJ5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
COLGALT1Q8NBJ5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
COLGALT1Q8NBJ5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
COLGALT1Q8NBJ5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
COLGALT1Q8NBJ5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
COLGALT1Q8NBJ5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COLGALT1Q8NBJ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COLGALT1Q8NBJ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COLGALT1Q8NBJ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COLGALT1Q8NBJ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COLGALT1Q8NBJ5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COLGALT1Q8NBJ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COLGALT1Q8NBJ5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COLGALT1Q8NBJ5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COLGALT1Q8NBJ5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COLGALT1Q8NBJ5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COLGALT1Q8NBJ5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COLGALT1Q8NBJ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COLGALT1Q8NBJ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COLGALT1Q8NBJ5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
COLGALT1Q8NBJ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COLGALT1Q8NBJ5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COLGALT1Q8NBJ5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COLGALT1Q8NBJ5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COLGALT1Q8NBJ5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COLGALT1Q8NBJ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COLGALT1Q8NBJ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COLGALT1Q8NBJ5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
COLGALT1Q8NBJ5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
COLGALT1Q8NBJ5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COLGALT1Q8NBJ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COLGALT1Q8NBJ5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COLGALT1Q8NBJ5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COLGALT1Q8NBJ5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COLGALT1Q8NBJ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COLGALT1Q8NBJ5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COLGALT1Q8NBJ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COLGALT1Q8NBJ5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COLGALT1Q8NBJ5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COLGALT1Q8NBJ5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COLGALT1Q8NBJ5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COLGALT1Q8NBJ5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
COLGALT1Q8NBJ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COLGALT1Q8NBJ5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COLGALT1Q8NBJ5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COLGALT1Q8NBJ5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COLGALT1Q8NBJ5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COLGALT1Q8NBJ5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COLGALT1Q8NBJ5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COLGALT1Q8NBJ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COLGALT1Q8NBJ5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
COLGALT1Q8NBJ5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COLGALT1Q8NBJ5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COLGALT1Q8NBJ5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COLGALT1Q8NBJ5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COLGALT1Q8NBJ5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COLGALT1Q8NBJ5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COLGALT1Q8NBJ5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COLGALT1Q8NBJ5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COLGALT1Q8NBJ5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COLGALT1Q8NBJ5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COLGALT1Q8NBJ5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COLGALT1Q8NBJ5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COLGALT1Q8NBJ5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COLGALT1Q8NBJ5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COLGALT1Q8NBJ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COLGALT1Q8NBJ5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COLGALT1Q8NBJ5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COLGALT1Q8NBJ5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
COLGALT1Q8NBJ5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COLGALT1Q8NBJ5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COLGALT1Q8NBJ5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COLGALT1Q8NBJ5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COLGALT1Q8NBJ5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COLGALT1Q8NBJ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COLGALT1Q8NBJ5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COLGALT1Q8NBJ5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COLGALT1Q8NBJ5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COLGALT1Q8NBJ5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COLGALT1Q8NBJ5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COLGALT1Q8NBJ5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COLGALT1Q8NBJ5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COLGALT1Q8NBJ5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COLGALT1Q8NBJ5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COLGALT1Q8NBJ5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
COLGALT1Q8NBJ5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COLGALT1Q8NBJ5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COLGALT1Q8NBJ5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COLGALT1Q8NBJ5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms