Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG16L2Q8NAA4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG16L2Q8NAA4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATG16L2Q8NAA4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATG16L2Q8NAA4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG16L2Q8NAA4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG16L2Q8NAA4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG16L2Q8NAA4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG16L2Q8NAA4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG16L2Q8NAA4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG16L2Q8NAA4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG16L2Q8NAA4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG16L2Q8NAA4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG16L2Q8NAA4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG16L2Q8NAA4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG16L2Q8NAA4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG16L2Q8NAA4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG16L2Q8NAA4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG16L2Q8NAA4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG16L2Q8NAA4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG16L2Q8NAA4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG16L2Q8NAA4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG16L2Q8NAA4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG16L2Q8NAA4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG16L2Q8NAA4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG16L2Q8NAA4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG16L2Q8NAA4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG16L2Q8NAA4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG16L2Q8NAA4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG16L2Q8NAA4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG16L2Q8NAA4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG16L2Q8NAA4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATG16L2Q8NAA4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATG16L2Q8NAA4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG16L2Q8NAA4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG16L2Q8NAA4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG16L2Q8NAA4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG16L2Q8NAA4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG16L2Q8NAA4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG16L2Q8NAA4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG16L2Q8NAA4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG16L2Q8NAA4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG16L2Q8NAA4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG16L2Q8NAA4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG16L2Q8NAA4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG16L2Q8NAA4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG16L2Q8NAA4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG16L2Q8NAA4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG16L2Q8NAA4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG16L2Q8NAA4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG16L2Q8NAA4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG16L2Q8NAA4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG16L2Q8NAA4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG16L2Q8NAA4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG16L2Q8NAA4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG16L2Q8NAA4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG16L2Q8NAA4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATG16L2Q8NAA4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG16L2Q8NAA4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG16L2Q8NAA4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG16L2Q8NAA4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG16L2Q8NAA4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG16L2Q8NAA4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG16L2Q8NAA4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG16L2Q8NAA4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG16L2Q8NAA4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG16L2Q8NAA4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG16L2Q8NAA4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG16L2Q8NAA4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG16L2Q8NAA4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG16L2Q8NAA4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG16L2Q8NAA4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG16L2Q8NAA4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG16L2Q8NAA4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG16L2Q8NAA4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG16L2Q8NAA4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG16L2Q8NAA4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG16L2Q8NAA4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG16L2Q8NAA4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG16L2Q8NAA4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG16L2Q8NAA4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG16L2Q8NAA4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG16L2Q8NAA4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG16L2Q8NAA4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG16L2Q8NAA4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG16L2Q8NAA4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG16L2Q8NAA4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG16L2Q8NAA4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG16L2Q8NAA4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG16L2Q8NAA4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG16L2Q8NAA4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG16L2Q8NAA4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG16L2Q8NAA4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG16L2Q8NAA4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG16L2Q8NAA4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG16L2Q8NAA4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG16L2Q8NAA4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms