Protein–RNA interactions for Protein: Q8N715

CCDC185, Coiled-coil domain-containing protein 185, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC185Q8N715 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC185Q8N715 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC185Q8N715 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC185Q8N715 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC185Q8N715 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC185Q8N715 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC185Q8N715 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC185Q8N715 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC185Q8N715 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC185Q8N715 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC185Q8N715 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC185Q8N715 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC185Q8N715 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC185Q8N715 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC185Q8N715 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC185Q8N715 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC185Q8N715 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC185Q8N715 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC185Q8N715 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC185Q8N715 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC185Q8N715 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC185Q8N715 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC185Q8N715 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC185Q8N715 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC185Q8N715 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC185Q8N715 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC185Q8N715 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC185Q8N715 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC185Q8N715 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC185Q8N715 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC185Q8N715 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC185Q8N715 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC185Q8N715 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC185Q8N715 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC185Q8N715 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC185Q8N715 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC185Q8N715 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC185Q8N715 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC185Q8N715 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC185Q8N715 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC185Q8N715 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC185Q8N715 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC185Q8N715 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC185Q8N715 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC185Q8N715 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC185Q8N715 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC185Q8N715 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC185Q8N715 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC185Q8N715 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC185Q8N715 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC185Q8N715 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC185Q8N715 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC185Q8N715 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC185Q8N715 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC185Q8N715 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC185Q8N715 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC185Q8N715 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC185Q8N715 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC185Q8N715 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC185Q8N715 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC185Q8N715 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC185Q8N715 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC185Q8N715 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC185Q8N715 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC185Q8N715 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC185Q8N715 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC185Q8N715 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC185Q8N715 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC185Q8N715 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC185Q8N715 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC185Q8N715 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC185Q8N715 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC185Q8N715 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC185Q8N715 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC185Q8N715 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC185Q8N715 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC185Q8N715 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC185Q8N715 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC185Q8N715 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC185Q8N715 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC185Q8N715 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC185Q8N715 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC185Q8N715 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC185Q8N715 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC185Q8N715 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC185Q8N715 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC185Q8N715 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC185Q8N715 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC185Q8N715 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC185Q8N715 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC185Q8N715 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC185Q8N715 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC185Q8N715 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC185Q8N715 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC185Q8N715 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC185Q8N715 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC185Q8N715 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC185Q8N715 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC185Q8N715 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC185Q8N715 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms