Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M8

IQCF1, IQ domain-containing protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCF1Q8N6M8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQCF1Q8N6M8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IQCF1Q8N6M8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IQCF1Q8N6M8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQCF1Q8N6M8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQCF1Q8N6M8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IQCF1Q8N6M8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IQCF1Q8N6M8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IQCF1Q8N6M8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IQCF1Q8N6M8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQCF1Q8N6M8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQCF1Q8N6M8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQCF1Q8N6M8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQCF1Q8N6M8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IQCF1Q8N6M8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IQCF1Q8N6M8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IQCF1Q8N6M8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IQCF1Q8N6M8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IQCF1Q8N6M8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IQCF1Q8N6M8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IQCF1Q8N6M8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IQCF1Q8N6M8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IQCF1Q8N6M8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IQCF1Q8N6M8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IQCF1Q8N6M8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IQCF1Q8N6M8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IQCF1Q8N6M8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IQCF1Q8N6M8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQCF1Q8N6M8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQCF1Q8N6M8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQCF1Q8N6M8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQCF1Q8N6M8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQCF1Q8N6M8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IQCF1Q8N6M8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IQCF1Q8N6M8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IQCF1Q8N6M8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IQCF1Q8N6M8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IQCF1Q8N6M8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IQCF1Q8N6M8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IQCF1Q8N6M8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IQCF1Q8N6M8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IQCF1Q8N6M8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IQCF1Q8N6M8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IQCF1Q8N6M8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IQCF1Q8N6M8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQCF1Q8N6M8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQCF1Q8N6M8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQCF1Q8N6M8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQCF1Q8N6M8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQCF1Q8N6M8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQCF1Q8N6M8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQCF1Q8N6M8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQCF1Q8N6M8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQCF1Q8N6M8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQCF1Q8N6M8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQCF1Q8N6M8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IQCF1Q8N6M8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IQCF1Q8N6M8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQCF1Q8N6M8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IQCF1Q8N6M8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQCF1Q8N6M8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQCF1Q8N6M8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IQCF1Q8N6M8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IQCF1Q8N6M8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IQCF1Q8N6M8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IQCF1Q8N6M8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IQCF1Q8N6M8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IQCF1Q8N6M8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IQCF1Q8N6M8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IQCF1Q8N6M8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IQCF1Q8N6M8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQCF1Q8N6M8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQCF1Q8N6M8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IQCF1Q8N6M8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQCF1Q8N6M8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQCF1Q8N6M8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQCF1Q8N6M8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IQCF1Q8N6M8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQCF1Q8N6M8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IQCF1Q8N6M8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IQCF1Q8N6M8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms