Protein–RNA interactions for Protein: Q8N468

MFSD4A, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD4AQ8N468 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD4AQ8N468 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD4AQ8N468 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD4AQ8N468 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD4AQ8N468 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD4AQ8N468 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD4AQ8N468 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD4AQ8N468 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD4AQ8N468 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD4AQ8N468 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFSD4AQ8N468 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFSD4AQ8N468 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MFSD4AQ8N468 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFSD4AQ8N468 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD4AQ8N468 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD4AQ8N468 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD4AQ8N468 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFSD4AQ8N468 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFSD4AQ8N468 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFSD4AQ8N468 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFSD4AQ8N468 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD4AQ8N468 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD4AQ8N468 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MFSD4AQ8N468 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MFSD4AQ8N468 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD4AQ8N468 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD4AQ8N468 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD4AQ8N468 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD4AQ8N468 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD4AQ8N468 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD4AQ8N468 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD4AQ8N468 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD4AQ8N468 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MFSD4AQ8N468 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MFSD4AQ8N468 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MFSD4AQ8N468 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MFSD4AQ8N468 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD4AQ8N468 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD4AQ8N468 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD4AQ8N468 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD4AQ8N468 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD4AQ8N468 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD4AQ8N468 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD4AQ8N468 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD4AQ8N468 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD4AQ8N468 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD4AQ8N468 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD4AQ8N468 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD4AQ8N468 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD4AQ8N468 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD4AQ8N468 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD4AQ8N468 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD4AQ8N468 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD4AQ8N468 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD4AQ8N468 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD4AQ8N468 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD4AQ8N468 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD4AQ8N468 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD4AQ8N468 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD4AQ8N468 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD4AQ8N468 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD4AQ8N468 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD4AQ8N468 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD4AQ8N468 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD4AQ8N468 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD4AQ8N468 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD4AQ8N468 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD4AQ8N468 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD4AQ8N468 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD4AQ8N468 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD4AQ8N468 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD4AQ8N468 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MFSD4AQ8N468 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MFSD4AQ8N468 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MFSD4AQ8N468 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MFSD4AQ8N468 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MFSD4AQ8N468 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MFSD4AQ8N468 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MFSD4AQ8N468 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MFSD4AQ8N468 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MFSD4AQ8N468 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MFSD4AQ8N468 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MFSD4AQ8N468 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MFSD4AQ8N468 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MFSD4AQ8N468 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MFSD4AQ8N468 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MFSD4AQ8N468 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MFSD4AQ8N468 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MFSD4AQ8N468 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MFSD4AQ8N468 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MFSD4AQ8N468 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MFSD4AQ8N468 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MFSD4AQ8N468 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MFSD4AQ8N468 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MFSD4AQ8N468 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MFSD4AQ8N468 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MFSD4AQ8N468 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MFSD4AQ8N468 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MFSD4AQ8N468 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MFSD4AQ8N468 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms